RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF225Q9UK10 706 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 THSD7BQ9C0I4 1608 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGPAT2O15120 278 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAMP3O60896 148 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNNO75324 88 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPAG6O75602 509 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 GIPP09681 153 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 MDKP21741 143 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL12AP29459 219 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTRLP40313 264 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLP1RP43220 463 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIR2DS4P43632 304 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCT3P49368 545 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPM6AP51674 278 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLX1P56177 255 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF763Q0D2J5 394 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNC119Q13432 240 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPM6BQ13491 265 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPPED2Q15777 294 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP6AP1Q15904 470 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 NRF1Q16656 503 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 MICBQ29980 383 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKDD1AQ495B1 522 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 BOLA3Q53S33 107 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFT2D3Q587I9 215 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMRTC1Q5HYR2 192 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDZK1Q5T2W1 519 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CASC10Q5T4H9 136 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4F3Q6IEY1 312 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf89Q6UWU4 347 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS41Q7RTY9 318 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 MKXQ8IYA7 352 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf223Q8N319 242 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNKDQ8N490 385 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACOT4Q8N9L9 421 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6C4Q8NGE1 309 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO30Q8TB52 745 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF138Q8WVD3 245 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARPC1AQ92747 370 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 UFD1Q92890 307 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2E3Q969T4 207 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXorf40BQ96DE9 158 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CMTM7Q96FZ5 175 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIMD4Q96H15 378 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPS8Q99627 209 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASL11BQ9BPW5 248 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRACR2AQ9BSW2 395 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM43Q9BTV4 400 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAPS2Q9BXY5 557 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 HES7Q9BYE0 225 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PARD6BQ9BYG5 372 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTR6Q9GZN1 396 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ROGDIQ9GZN7 287 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 C20orf85Q9H1P6 137 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 VCX2Q9H322 139 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 GORASP2Q9H8Y8 452 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEC14L3Q9UDX4 400 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDH9Q9ULB4 789 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMCC3Q9ULS5 477 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEU3Q9UQ49 428 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTCH1Q13635 1447 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GUA9 196 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCP4L1A6NKN8 68 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CA11O75493 328 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLDN9O95484 217 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHTF8P0CG12 524 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSG2P11465 335 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ICAM2P13598 275 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CMA1P23946 247 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCR1P32246 355 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDT1P36639 197 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSR1P43307 286 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 HLCSP50747 726 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms