RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 PFDN4Q9NQP4 134 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD12Q6UB98 2062 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAV34A0A0B4J273 112 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1B0GVI7 797 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 C5orf51A6NDU8 294 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR6C65A6NJZ3 312 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 BTNL10A8MVZ5 291 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC22O60826 627 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 RP2O75695 350 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 LCA5LO95447 670 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 APCSP02743 223 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDHBP11177 359 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 HPGDP15428 266 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHMT2P34897 504 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 COPB2P35606 906 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGEA4P43358 317 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYKP43405 635 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 NAMPTP43490 491 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 HTR5AP47898 357 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 PITPNBP48739 271 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL1RL1Q01638 556 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 BDH1Q02338 343 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFT88Q13099 833 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTK6Q13882 451 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMUG1Q53HV7 270 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFAP58Q5T655 872 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 HES5Q5TA89 166 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 TIGD3Q6B0B8 471 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRMT9Q6P2P2 845 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCYL2Q6P3W7 929 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 CBLN3Q6UW01 205 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 CES3Q6UWW8 571 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM47EQ6ZV65 393 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMC5Q8IY18 1101 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 STPG2Q8N412 459 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2G3Q8NGZ4 309 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 ST8SIA1Q92185 356 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A46Q96AG3 418 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SDSLQ96GA7 329 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF145Q96MT1 663 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSPG4P5Q96PW8 444 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 ECSITQ9BQ95 431 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFKBIZQ9BYH8 718 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 TXLNGYQ9BZA5 131 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM206Q9H813 350 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEPT10Q9P0V9 454 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPS15L1Q9UBC2 864 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYTH4Q9UIA0 394 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 LTBP2Q14767 1821 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH3TC1Q8TE82 1336 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 DOCK10Q96BY6 2186 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0U1RQV1 116 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGEF35A5YM69 484 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR6C70A6NIJ9 312 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 C12orf71A8MTZ7 269 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 P4HA2O15460 535 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAPBPO15533 448 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 STX11O75558 287 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 HLA-DQA1P01909 254 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT14P02533 472 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 BCHEP06276 602 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 HBQ1P09105 142 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 P0DMU3 169 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM231AP0DMU4 169 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM231CP0DMU5 169 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANXA3P12429 323 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 POU2F1P14859 743 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABOP16442 354 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 BDKRB1P46663 353 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYB561P49447 251 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMSP52788 366 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDH4P55283 916 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 HERVK_113P63132 956 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERVK-8P63133 956 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCN1BQ07699 218 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGS1Q08116 209 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 NME3Q13232 169 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPIL2Q13356 520 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms