RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.52□□□□□ -0.09
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PDGFB-201ENST00000331163 ITGAMP11215 1152 aa14.51□□□□□ -0.09
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PDGFB-201ENST00000331163 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.51□□□□□ -0.09
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PDGFB-201ENST00000331163 RGS13O14921 159 aa14.5□□□□□ -0.09
PDGFB-201ENST00000331163 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PDGFB-201ENST00000331163 YES1P07947 543 aa14.5□□□□□ -0.09
PDGFB-201ENST00000331163 TSPAN19P0C672 248 aa14.5□□□□□ -0.09
PDGFB-201ENST00000331163 PRKACBP22694 351 aa14.5□□□□□ -0.09
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