RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 LYNX1P0DP58 116 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 NEFHP12036 1026 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK1P28482 360 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD52P43351 418 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPZA2P47755 286 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MTNR1AP48039 350 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR6P50406 440 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP4BP51164 291 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 HPCAP84074 193 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 H3F3AP84243 136 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 NPRL3Q12980 569 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SKP2Q13309 424 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 GNA13Q14344 377 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC17A1Q14916 467 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR68Q15743 365 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MOGQ16653 247 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 UNC50Q53HI1 259 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 FBLN7Q53RD9 439 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP157Q5JU67 520 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM209AQ5JX71 171 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 DOK3Q7L591 496 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 GPAT4Q86UL3 456 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX32Q86XE0 403 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC103Q8IW40 242 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK20Q8IZL9 346 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ST7LQ8TDW4 575 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB1CQ92928 201 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf109Q9NX04 203 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 HMX2A2RU54 273 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN25C9JDP6 229 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN34H7C241 214 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CFLARO15519 480 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 OIP5O43482 229 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP10O43572 662 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PLPP2O43688 288 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJA2O60884 412 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ENTPD5O75356 428 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 LGI1O95970 557 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT17P0C025 328 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 UROSP10746 265 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CALCRP30988 508 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RYKP34925 604 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GLRXP35754 106 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEA12P43365 314 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKAA2P54646 552 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC3A1Q07837 685 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF141Q15928 474 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT80Q6KB66 452 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CREG2Q8IUH2 290 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4F5Q8NH21 305 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SFXN5Q8TD22 340 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB8BQ92930 207 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM237Q96Q45 408 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SDF2Q99470 211 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 BEX1Q9HBH7 125 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ESM1Q9NQ30 184 aa6.77□□□□□ -1.33
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