RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa17.37■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 KIF25Q9UIL4 384 aa17.37■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa17.37■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SLC7A9P82251 487 aa17.37■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 PHF19Q5T6S3 580 aa17.37■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 OR5D14Q8NGL3 314 aa17.37■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SFXN2Q96NB2 322 aa17.37■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 DNTTIP1Q9H147 329 aa17.37■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa17.37■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 RAB19A4D1S5 217 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 FASLGP48023 281 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 XAF1Q6GPH4 301 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 USP51Q70EK9 711 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SLC25A46Q96AG3 418 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 ARPC5LQ9BPX5 153 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 DZANK1Q9NVP4 752 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 K7EPK0 472 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 C5AR1P21730 350 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 FAM71E1Q6IPT2 247 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 TM4SF18Q96CE8 201 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM23P36406 574 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 ETV5P41161 510 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SIRPAP78324 504 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 RUNX3Q13761 415 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF750Q32MQ0 723 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SLC22A6Q4U2R8 563 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 FOXN4Q96NZ1 517 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 GLIPR2Q9H4G4 154 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 NRIP3Q9NQ35 241 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 NIT2Q9NQR4 276 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SDHAF2Q9NX18 166 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 ECM29Q5VYK3 1845 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 CR2P20023 1033 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 EMP2P54851 167 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SELENBP1Q13228 472 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SYT14P1Q58G82 188 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 GPR155Q7Z3F1 870 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 ST8SIA4Q92187 359 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 LRRC46Q96FV0 321 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 DDOQ99489 341 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SAMD10Q9BYL1 202 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 PDFQ9HBH1 243 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 MARCH5Q9NX47 278 aa17.36■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 MAGEB1P43366 347 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 PDE7AQ13946 482 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 GBX1Q14549 363 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 HMGN3Q15651 99 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 GPR139Q6DWJ6 353 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 KDM8Q8N371 416 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 HMGCLL1Q8TB92 370 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 ZDHHC12Q96GR4 267 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SLC19A3Q9BZV2 496 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 CREBZFQ9NS37 354 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SGK494L7N484 410 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SLCO2B1O94956 709 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 EOGTQ5NDL2 527 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 MMP21Q8N119 569 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 MARC2Q969Z3 335 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 GABARAPL3Q9BY60 117 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SLX4Q8IY92 1834 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 HSBP1L1C9JCN9 74 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 TSPAN12O95859 305 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 PLA2G7Q13093 441 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 TNK1Q13470 666 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 LTB4RQ15722 352 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SEC22CQ9BRL7 303 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SMCO4Q9NRQ5 59 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 INIPQ9NRY2 104 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 CLDND1Q9NY35 253 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 APBB3O95704 486 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 NME2P22392 152 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 CCR9P51686 369 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 CLDN2P57739 230 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 CDC20Q12834 499 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 NXNL2Q5VZ03 156 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 RCBTB1Q8NDN9 531 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM255BQ8WV15 326 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 A4GALTQ9NPC4 353 aa17.35■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 OR8G3PP0DMU2 310 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF43P17038 809 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SRP9P49458 86 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 MALLQ13021 153 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 PYCR3Q53H96 274 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 MS4A8Q9BY19 250 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 A6NLC8 198 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 A8MXE2 369 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 SERPINA7P05543 415 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 CBR1P16152 277 aa17.34■□□□□ 0.37
PRKCI-201ENST00000295797 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms