RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM72A0PK05 275 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 HMX2A2RU54 273 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 DBHP09172 617 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 LACC1Q8IV20 430 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 OR52N1Q8NH53 320 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PAQR8Q8TEZ7 354 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 OR14A2Q96R54 314 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TUBB1Q9H4B7 451 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GLIPR2Q9H4G4 154 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MED20Q9H944 212 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 LRIT1Q9P2V4 623 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF254O75437 659 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CD6P30203 668 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MISPQ8IVT2 679 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF740Q8NDX6 193 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR56B1Q8NGI3 324 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR5L1Q8NGL2 311 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 RSPRY1Q96DX4 576 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR5M11Q96RB7 305 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 LUZP4Q9P127 313 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF10AO00220 468 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNB1P11230 501 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TM4SF4P48230 202 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MZT1Q08AG7 82 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA2P20848 420 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PFN3P60673 137 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLC14A1Q13336 389 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF674Q2M3X9 581 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 COX20Q5RI15 118 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 FAM71E1Q6IPT2 247 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PRR18Q8N4B5 295 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP19Q8WTR2 217 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 HHIPQ96QV1 700 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 VN1R3Q9BXE9 311 aa19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NUP98P52948 1817 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SSX4O60224 188 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 LILRB5O75023 590 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CSO75390 466 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CHRM4P08173 479 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 FAM111BQ6SJ93 734 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR9K2Q8NGE7 335 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf198Q9H425 327 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PPP3CBP16298 524 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 FOXK2Q01167 660 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PLCXD3Q63HM9 321 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 VRK3Q8IV63 474 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ACKR4Q9NPB9 350 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NOX4Q9NPH5 578 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SNX11Q9Y5W9 270 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TACR3P29371 465 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 VASPP50552 380 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TNK1Q13470 666 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZNX1 250 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS14Q8TCE9 139 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MIB2Q96AX9 1013 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SNX18Q96RF0 628 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC8Q9BY41 377 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 METTL9Q9H1A3 318 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLC34A2O95436 690 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 APEX1P27695 318 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 HTR2CP28335 458 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SHC1P29353 583 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SORDQ00796 357 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 GALEQ14376 348 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 FAM78AQ5JUQ0 283 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SUMF2Q8NBJ7 301 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM106AQ96A25 262 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 A8MXE2 369 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CRMP1Q14194 572 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLC48A1Q6P1K1 146 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 GPR78Q96P69 363 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF286AQ9HBT8 521 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS16Q9NQE7 514 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R16Q9NYV7 291 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CAMK2AQ9UQM7 478 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CDC14CA4D256 554 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR2A25A4D2G3 310 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C6A6NF89 314 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 D6RAR5 112 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TK1P04183 234 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 HOXB5P09067 269 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA9P31269 272 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 GPLD1P80108 840 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R3BQ86XI6 285 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR52I1Q8NGK6 324 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 FOXN4Q96NZ1 517 aa19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms