RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284073.6

MSI2-201, Transcript of musashi RNA binding protein 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI2, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2-201ENST00000284073 LDB3O75112 727 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 MAKP20794 623 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CCR7P32248 378 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CD300CQ08708 224 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 MLC1Q15049 377 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 C4orf17Q53FE4 359 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TMEM106AQ96A25 262 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 DCTN6O00399 190 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ZNF43P17038 809 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.74□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 NME2P1O60361 137 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TMED6Q8WW62 240 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ZFP92A6NM28 416 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 H7C1C5 153 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 S100A8P05109 93 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 HOXB2P14652 356 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 GABRB1P18505 474 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 MAOBP27338 520 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CD70P32970 193 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 LCN6P62502 163 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 DGCR2P98153 550 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 GPRIN2O60269 458 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 RAD52P43351 418 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 XCR1P46094 333 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 RAP1AP62834 184 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 GPR137BO60478 399 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 RAB28P51157 221 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 AARDQ4LEZ3 155 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 KPTNQ9Y664 436 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PMS2P2O95744 297 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CHRNEQ04844 493 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SHEQ5VZ18 495 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SGK3Q96BR1 496 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PELI2Q9HAT8 420 aa14.73□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 HTR2CP28335 458 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PRR14Q9BWN1 585 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CSF3P09919 207 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SFTPDP35247 375 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SLC19A1P41440 591 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ACTBL2Q562R1 376 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CR2P20023 1033 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CDH26Q8IXH8 852 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CLN5O75503 358 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms