RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SYP-201ENST00000263233 MYADMQ96S97 322 aa13.69□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 FGF22Q9HCT0 170 aa13.69□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 TAS2R5Q9NYW4 299 aa13.69□□□□□ -0.22
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