RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ADOQ96SZ5 270 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 AMELYQ99218 206 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 GFI1Q99684 422 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 MED18Q9BUE0 208 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 WDR76Q9H967 626 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 FAM172BPA6NC97 362 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 NOTOA8MTQ0 251 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 RCBTB2O95199 551 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SEMA4FO95754 770 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 NUDT14O95848 222 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 IGHV4-34P06331 123 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 CLDN20P56880 219 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 KIR2DS3Q14952 304 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 POU4F3Q15319 338 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 MEP1BQ16820 701 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 RNLSQ5VYX0 342 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 MZT2AQ6P582 158 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ZNF527Q8NB42 609 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SNX18Q96RF0 628 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 NPAS1Q99742 590 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 NANSQ9NR45 359 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 RCE1Q9Y256 329 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 CACNG2Q9Y698 323 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 C2orf74A8MZ97 194 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 FOXS1O43638 330 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ZFPL1O95159 310 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ATP1B1P05026 303 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 CT45A8P0DMV1 189 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 CT45A9P0DMV2 189 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 HK1P19367 917 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SLC2A5P22732 501 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 GZMKP49863 264 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ETFDHQ16134 617 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 NT5CQ8TCD5 201 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 KCNJ15Q99712 375 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 MED28Q9H204 178 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 LAMA5O15230 3695 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 H0YIG0 161 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 CHP2O43745 196 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SIX6O95475 246 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 S100A1P23297 94 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 AHCYP23526 432 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SELENOPP49908 381 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 EFNA3P52797 238 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ST3GAL2Q16842 350 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 EIPR1Q53HC9 387 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZTK2 550 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 MED25Q71SY5 747 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 GID4Q8IVV7 300 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 BCORP1Q8N888 145 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 GPR119Q8TDV5 335 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 GPR89AB7ZAQ6 455 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 RGS13O14921 159 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SSNA1O43805 119 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ORC5O43913 435 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 WNT11O96014 354 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 GPR89BP0CG08 455 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 EPXP11678 715 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ITPKBP27987 946 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 ZP2Q05996 745 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 LTBQ06643 244 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 FZD2Q14332 565 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 FGFBP1Q14512 234 aa7.93□□□□□ -1.14
GINS1-201ENST00000262460 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms