RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 CTGFP29279 349 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 DLSTP36957 453 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PPT1P50897 306 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PGDP52209 483 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF345Q14585 488 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ACER2Q5QJU3 275 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ARMC5Q96C12 935 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 HAVCR1Q96D42 359 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 BBS4Q96RK4 519 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PFDN5Q99471 154 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 GFI1Q99684 422 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 IL21RQ9HBE5 538 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 V9GY05 133 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 BHLHE40O14503 412 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 TBX19O60806 448 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 VNN2O95498 520 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 C1orf105O95561 183 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 THY1P04216 161 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 GYPBP06028 91 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ABCD3P28288 659 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PRKAR1BP31321 381 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 MPIP34949 423 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ST8SIA6P61647 398 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ACTC1P68032 377 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ACTA1P68133 377 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SIRPAP78324 504 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 MORN1Q5T089 497 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 STPG1Q5TH74 334 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PELI1Q96FA3 418 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ASF1AQ9Y294 204 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 NUMA1Q14980 2115 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ACOD1A6NK06 481 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 OR2T1O43869 369 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 GKN3PP0CG01 181 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 GTF2F2P13984 249 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 IL9P15248 144 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF44P15621 663 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.344e-6■□□□□ 10
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CSDE1-201ENST00000261443 THPOP40225 353 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 FOXK2Q01167 660 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CAP1Q01518 475 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF234Q14588 700 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CD180Q99467 661 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SGPP1Q9BX95 441 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 POFUT1Q9H488 388 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 RNF122Q9H9V4 155 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CMC2Q9NRP2 79 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.65□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 VWA8A3KMH1 1905 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 POM121BA6NF01 834 aa6.65□□□□□ -1.35
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