RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM107Q6UX40 140 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE3DQ7Z6J8 389 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 COL26A1Q96A83 441 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF304Q9HCX3 659 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPB11Q9Y547 144 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM30A4D0T7 59 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 APOL3O95236 402 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 LALBAP00709 142 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPZA2P47755 286 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR5P85299 388 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PGGHGQ32M88 737 aa24.11■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF311Q5JNZ3 666 aa24.11■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR5T3Q8NGG3 340 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 NT5CQ8TCD5 201 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 RFT1Q96AA3 541 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 EXTL2Q9UBQ6 330 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 MALT1Q9UDY8 824 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKAR1BP31321 381 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SSR2P43308 183 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 FUT5Q11128 374 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 IL10RAQ13651 578 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM53BQ14153 422 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ERV3-1Q14264 604 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS58Q8IYP2 241 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC17Q8N6Y2 441 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 HDHD2Q9H0R4 259 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 LRIT2A6NDA9 550 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SOX18P35713 384 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP41Q8N8Y5 198 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 INPP5EQ9NRR6 644 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 TCFL5Q9UL49 500 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0X1KG70 313 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf66A4D0T2 115 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2W5A6NFC9 320 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 C21orf140B9A014 251 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 K7ENP7 123 aa24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 RDH16O75452 317 aa24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1E1P36543 226 aa24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T33Q8NG76 320 aa24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 UCN3Q969E3 161 aa24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 FN3KQ9H479 309 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 HCN3Q9P1Z3 774 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 COPZ2Q9P299 210 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGFRNQ9P2B2 879 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PCSK5Q92824 1860 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 BSNQ9UPA5 3926 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 MED13Q9UHV7 2174 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 J3QRE1 110 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF4O43474 513 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5F1O95221 314 aa24.08■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 EFNA3P52797 238 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CTBP2P56545 445 aa24.08■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 GPR176Q14439 515 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf62Q8N4C0 152 aa24.08■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 GPR137Q96N19 417 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 MED28Q9H204 178 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 TEKT2Q9UIF3 430 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A7Q9Y694 548 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SHOXO15266 292 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 EMC8O43402 210 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM10L1P0DMW3 83 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS3P57727 454 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 TGM3Q08188 693 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF620Q6ZNG0 422 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa24.08■■□□□ 1.44
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