RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MKS1Q9NXB0 559 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 OPN4Q9UHM6 478 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.12□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SULT2B1O00204 365 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PLPP2O43688 288 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MPZL1O95297 269 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00032P0C843 101 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 BCKDHAP12694 445 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 COL8A2P25067 703 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MPGP29372 298 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PRKAG1P54619 331 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZPA2 131 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SZRD1Q7Z422 152 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 BIRC6Q9NR09 4857 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 UPB1Q9UBR1 384 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MID2Q9UJV3 735 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.11□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 M0QZ24 198 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PLXNB1O43157 2135 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV1-44P01699 117 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 HPXP02790 462 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 XKR7Q5GH72 579 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CCNJQ5T5M9 372 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PIGXQ8TBF5 258 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 YIPF5Q969M3 257 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CITED1Q99966 193 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.1□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN34H7C241 214 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PIP5K1BO14986 540 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PIN1P1O15428 100 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM13O60858 407 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 FGF4P08620 206 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ANPEPP15144 967 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH3A1P30838 453 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ARRB2P32121 409 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ASMTP46597 345 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 QPRTQ15274 297 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GALNTL6Q49A17 601 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SYT14P1Q58G82 188 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 COX18Q8N8Q8 333 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MTERF3Q96E29 417 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 APOPT1Q96IL0 206 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MECRQ9BV79 373 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.09□□□□□ -0.15
SPCS1-201ENST00000233025 RP2O75695 350 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ALOX5P09917 674 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM33P57088 247 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 GUCY1A3Q02108 690 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL26Q53HC5 615 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC103Q8IW40 242 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 JADE3Q92613 823 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 RDH5Q92781 318 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A28Q96A46 364 aa14.08□□□□□ -0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms