RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 ICOSLGO75144 302 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 DLGAP3O95886 979 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 BIKQ13323 160 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 NSDHLQ15738 373 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 BCL2A1Q16548 175 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ARMC4Q5T2S8 1044 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 DEFB124Q8NES8 71 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZPLD1Q8TCW7 415 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 WDFY2Q96P53 400 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SP140LQ9H930 580 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 FGF21Q9NSA1 209 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 DCHS1Q96JQ0 3298 aa16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 FRG2CA6NGY1 282 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 D6RAR5 112 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 LRP3O75074 770 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SNX4O95219 450 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 HLA-DPB1P04440 258 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 RPL4P36578 427 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 NHLH1Q02575 133 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 OR8H2Q8N162 312 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZNF527Q8NB42 609 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZNRF4Q8WWF5 429 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 KLHL1Q9NR64 748 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 CTSFQ9UBX1 484 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 DYRK3O43781 588 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 OR7A10O76100 309 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 IFNGP01579 166 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 EBPQ15125 230 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 RPTNQ6XPR3 784 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 PRSS42Q7Z5A4 293 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 CARFQ8N187 725 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 MOSPD2Q8NHP6 518 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 C4orf36Q96KX1 117 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 VN1R1Q9GZP7 353 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.54■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 A0A1B0GX78 115 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SLC35F4A4IF30 521 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZNF264O43296 627 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ADH7P40394 386 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 OR12D2P58182 307 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 E2F1Q01094 437 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 CDC20Q12834 499 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 BAK1Q16611 211 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ELOA3Q8NG57 546 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 OR5W2Q8NH69 310 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 RASD2Q96D21 266 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 CCDC32Q9BV29 185 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 HOXD1Q9GZZ0 328 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ASB6Q9NWX5 421 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 TRAPPC4Q9Y296 219 aa16.53■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 J3QLW9 94 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SERPINI2O75830 405 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 MPDZO75970 2070 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 TFP02787 698 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZNF19P17023 458 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ERVK-25P63136 954 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 BDH1Q02338 343 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ARL9Q6T311 187 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 GDPD3Q7L5L3 318 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 MOGAT1Q96PD6 335 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 NMNAT3Q96T66 252 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SRRQ9GZT4 340 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 TRIM36Q9NQ86 728 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 TIGARQ9NQ88 270 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 TBC1D24Q9ULP9 559 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZNF337Q9Y3M9 751 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 PPM1BO75688 479 aa16.52■□□□□ 0.23
USP18-201ENST00000215794 PTTG1O95997 202 aa16.52■□□□□ 0.23
USP18-201ENST00000215794 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
USP18-201ENST00000215794 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms