RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ca5bQ9QZA0 317 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spag17Q5S003 2320 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ckap5A2AGT5 2032 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Parp4E9PYK3 1969 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 9330182O14RikJ3QNB2 140 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cfl2P45591 166 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lad1P57016 528 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 UradQ283N4 178 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc27a5Q4LDG0 689 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr140Q60878 302 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adgrd1Q80T32 903 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tm9sf4Q8BH24 643 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2810021J22RikQ8BIB6 539 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P2rx2Q8K3P1 485 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc35a3Q8R1T4 326 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ucn3Q924A4 164 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp84Q9D654 559 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppa1Q9D819 289 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bbs10Q9DBI2 713 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Moap1Q9ERH6 352 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Jmjd6Q9ERI5 403 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bloc1s6Q9R0C0 172 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 LipgQ9WVG5 500 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp1r17Q9Z2E4 159 aa18.18■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm16432A0A0A6YXX9 775 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CyctP00015 105 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp6v1e1P50518 226 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 E2f1Q61501 430 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Exosc3Q7TQK4 274 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Crb3Q8QZT4 113 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dapk2Q8VDF3 370 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1387Q8VFA9 311 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HypmQ9CR04 117 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9CR55 154 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dhrs7Q9CXR1 338 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ethe1Q9DCM0 254 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bmp10Q9R229 421 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eci2Q9WUR2 391 aa18.17■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv16-1A0A0A6YW39 117 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm3149E9PW52 257 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm21103E9Q2Q1 267 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm3476K7N6V0 257 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm8362K7N6Y6 257 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmd4O35226 376 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdk1P11440 297 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DbiP31786 87 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sox6P40645 827 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ier3P46694 153 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Barhl1P63157 327 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HbegfQ06186 208 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Grxcr2Q3TYR5 254 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nlrc3Q5DU56 1064 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nr0b1Q61066 472 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snap91Q61548 901 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prap1Q80XD8 149 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wdr92Q8BGF3 357 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acaa2Q8BWT1 397 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Csnka2ipQ8CH19 720 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TifabQ8JZM6 147 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr870Q8VGG4 311 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Egln2Q91YE2 419 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9CQF4 240 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smim23Q9DAL0 136 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem176aQ9DCS1 244 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spo11Q9WTK8 396 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Btbd35f16A0A087WSN2 498 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm8973D3YX71 104 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr544E9PX47 334 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm21319F6YNI8 144 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm10260F6YVP7 152 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm3755K7N743 167 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1360K9J6X0 313 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RptnP97347 1118 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Col10a1Q05306 680 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tgtp2Q3T9E4 415 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gcnt7Q3V3K7 433 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wfdc5Q4KXB6 126 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Drd1Q61616 446 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dag1Q62165 893 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tgtp1Q62293 415 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CltbQ6IRU5 229 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpatch2Q7TQC7 527 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1359Q7TQU5 313 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc35c1Q8BLX4 363 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 OacylQ8BML2 685 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mettl6Q8BVH9 282 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Srpx2Q8R054 468 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ugt2b37Q8VCN3 530 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Paip1Q8VE62 400 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr672Q8VG28 312 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1417Q8VGJ6 315 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr61Q8VGM2 311 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spred1Q924S8 444 aa18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp5f1Q9CQQ7 256 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdca4Q9CWM2 237 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30 ms