RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004201.7

Col5a3-201, Transcript of Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col5a3, Length 6,119 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cypt4Q6P925 153 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gpr68Q8BFQ3 365 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr1423Q8VFV0 310 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr410Q8VFX7 315 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr402Q8VFX8 315 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem239Q9DA47 151 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mageh1Q9NWG9 218 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Spo11Q9WTK8 396 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc37a4A0A1L1SUI3 450 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 4931429L15RikE9PVU2 379 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr31E9Q3K2 317 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm9964E9Q9S5 144 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 9130204L05RikG3UWB8 92 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Jmjd7P0C872 316 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 AgrpP56473 131 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem14aP56983 99 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Psg28Q4KL66 472 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cfhr2Q4LDF6 332 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Enpp3Q6DYE8 874 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vmn1r48Q9EQ52 302 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Bmp7P23359 430 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 NfyaP23708 346 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pitx1P70314 315 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Irf4Q64287 450 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Shkbp1Q6P7W2 704 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr1115Q7TR53 326 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 QpctlQ8BH73 383 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr1086Q8VFL9 310 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr672Q8VG28 312 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr156Q8VGA9 318 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Adarb1Q91ZS8 711 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Uqcc2Q9CQY6 136 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfp773Q9CZ29 471 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Shmt2Q9CZN7 504 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Wdr89Q9D0R9 386 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vmn1r52Q9EP79 309 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Plscr3Q9JIZ9 296 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem37Q9JJV3 211 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Myh2G3UW82 1942 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vmn1r13G5E8I3 300 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam171bQ14CH0 825 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfp324Q78F42 583 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr1162Q7TR28 314 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc35b2Q91ZN5 431 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 ShpkQ9D5J6 476 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stard5Q9EPQ7 213 aa13.6□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 A26c2A0A140LHE4 291 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kiaa1324A2AFS3 1009 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mep1bQ61847 704 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Heatr6Q6P1G0 1184 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Poldip3Q8BG81 420 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Q8BPC6 396 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pars2Q8CFI5 475 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HinfpQ8K1K9 503 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc71Q8VEG0 433 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dnajb11Q99KV1 358 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 AgtrapQ9WVK0 161 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Myh7Q91Z83 1935 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm4969D3YZT1 566 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 ChrneP20782 493 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Igfbp2P47877 305 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gabrr1P56475 480 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tle1Q62440 770 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Surf4Q64310 269 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Oard1Q8R5F3 152 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Asb18Q8VHA6 467 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sfxn2Q925N2 322 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Chrm3Q9ERZ3 589 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dazap1Q9JII5 406 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr316A0A0N4SVP2 306 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 CtnsP57757 367 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfp987Q32P14 633 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PianpQ6P1B3 278 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 InavaQ7TN12 663 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zic5Q7TQ40 622 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Q80UB0 333 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Znf32Q80V23 272 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc30a8Q8BGG0 367 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc38a2Q8CFE6 504 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 NagsQ8R4H7 527 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rab7bQ8VEA8 199 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr1449Q8VEV8 314 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Spaca7Q9D2S4 182 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rab13Q9DD03 202 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nkx2-4Q9EQM3 354 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr1206A2ATJ9 307 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rab8bP61028 207 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gcnt7Q3V3K7 433 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Eid2Q6X7S9 236 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mrps10Q80ZK0 160 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ctdsp2Q8BX07 270 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 4933407L21RikQ9D476 131 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cldnd2Q9D9H2 167 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tp73Q9JJP2 631 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Asb1Q9WV74 336 aa13.59□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr225E9PWF9 419 aa13.58□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kbtbd7G5E8C2 690 aa13.58□□□□□ -0.23
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hsd3b6O35469 373 aa13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 91.8 ms