RNA–Protein interactions for RNA: YMR066W

SOV1, Transcript of Mitochondrial protein of unknown function, yeast

Gene SOV1, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOV1	YMR066W	YOR111W	Q99210	232 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SEC12	P11655	471 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	VBA3	P25594	458 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SWC3	P31376	625 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	GMH1	P36125	273 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	VBA5	P36172	582 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	BAP2	P38084	609 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SEA4	P38164	1038 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	PBY1	P38254	753 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YBP1	P38315	674 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	VHR1	P40522	640 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YIR016W	P40572	265 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	DAK2	P43550	591 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	CHA4	P43634	648 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ALY2	P47029	1046 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	GYP7	P48365	746 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ARP4	P80428	489 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	RIM13	Q03792	727 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YDR132C	Q03900	495 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	LCD1	Q04377	747 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	MRPL1	Q04599	285 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ADY4	Q05955	493 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	RGT2	Q12300	763 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	KCS1	Q12494	1050 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	GCR1	P07261	785 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	STE12	P13574	688 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SNF5	P18480	905 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YEL020C	P39994	560 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	VRG4	P40107	337 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	MDJ2	P42834	146 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SNO3	P43544	222 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ALR2	P43553	858 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	GYP8	P43570	497 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YJL043W	P47053	257 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	EXG2	P52911	562 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	NPY1	P53164	384 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YGR053C	P53234	283 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ATG4	P53867	494 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	CTR9	P89105	1077 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YPL071C	Q02864	156 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SRT1	Q03175	343 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ARO10	Q06408	635 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YLR040C	Q07988	224 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YPL216W	Q08964	1102 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	TGS1	Q12052	315 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	AIM44	Q99299	758 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YLR415C	O13578	112 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.38	□□□□□ -2.35	not detected
SOV1	YMR066W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	TOP3	P13099	656 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	DAL7	P21826	554 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YUR1	P26725	428 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	MCM2	P29469	868 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	HIR1	P32479	840 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	STE13	P33894	931 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	RER2	P35196	286 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	FMP52	P40008	231 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	SDS3	P40505	327 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	OPT1	P40897	799 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	GNP1	P48813	663 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	TEL2	P53038	688 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ERP6	P53198	216 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ATP23	P53722	227 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	BOP3	P53958	396 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YKR011C	Q02209	353 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	REC102	Q02721	264 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	MFM1	Q02783	413 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	EAF1	Q06337	982 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	GRS2	Q06817	618 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YDL073W	Q07454	984 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	ADY3	Q07732	790 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YPR071W	Q12346	211 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SOV1	YMR066W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35

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