RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 MCM5P33992 734 aa15.95■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.95■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.95■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TTC6Q86TZ1 520 aa15.95■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 MPNDQ8N594 471 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 KCNJ4P48050 445 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ATP5JP18859 108 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CHRNA2Q15822 529 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 UVSSAQ2YD98 709 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 FERMT3Q86UX7 667 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 MYH15Q9Y2K3 1946 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 PAPPAQ13219 1627 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ADCY5O95622 1261 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 PSMA5P28066 241 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SLFNL1Q499Z3 407 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 LIG1P18858 919 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 DCAF5Q96JK2 942 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 NBPF26B4DH59 902 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TERF1P54274 439 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 STK3Q13188 491 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 NBPF14Q5TI25 921 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 NBPF15Q8N660 670 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 RRP9O43818 475 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 JAK2O60674 1132 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 FOXO4P98177 505 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM94Q12767 1356 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087WZG4 1122 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 RNF20Q5VTR2 975 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 HAUS7Q99871 368 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 KDM4AO75164 1064 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CYP21A2P08686 494 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ELP1O95163 1332 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.88■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0G2JLW4 131 aa15.88■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 GTF3C6Q969F1 213 aa15.88■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD1Q15327 319 aa15.88■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.88■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 LMBR1LQ6UX01 489 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 KRT85P78386 507 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PALLDQ8WX93 1383 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 DCCP43146 1447 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 H7C1W4 665 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZUG5 572 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 NEK1Q96PY6 1258 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 RESTQ13127 1097 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PGBD1Q96JS3 809 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SH3TC1Q8TE82 1336 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 UQCRHLA0A096LP55 91 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf170-201ENST00000623052 UQCRHP07919 91 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms