RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 HUNKP57058 714 aa25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 NLRP3Q96P20 1036 aa25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 H7C1D1 291 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC102AQ96A19 550 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC184Q52MB2 194 aa25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 PARP10Q53GL7 1025 aa25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 RGMBQ6NW40 437 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 NGEFQ8N5V2 710 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 BBOX1O75936 387 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 GPTP24298 496 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 SUSD4Q5VX71 490 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 NTSR2O95665 410 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 SOX10P56693 466 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 SP8Q8IXZ3 490 aa25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 MPNDQ8N594 471 aa25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 ERBB4Q15303 1308 aa25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 MRS2Q9HD23 443 aa25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 TMC4Q7Z404 712 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 USP48Q86UV5 1035 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 DPF2Q92785 391 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 ABCC4O15439 1325 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-208ENST00000608287 APAF1O14727 1248 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 RAD17O75943 681 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 MICALL2Q8IY33 904 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 TTLL7Q6ZT98 887 aa25■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 GCC1Q96CN9 775 aa25■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 MYL6BP14649 208 aa24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 ZIC5Q96T25 663 aa24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.98■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 TRPA1O75762 1119 aa24.98■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 RNF186Q9NXI6 227 aa24.98■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.96■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.96■■□□□ 1.59
SGMS1-208ENST00000608287 SLC10A3P09131 477 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 GRAPQ13588 217 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 CHL1O00533 1208 aa24.93■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 SULF1Q8IWU6 871 aa24.93■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 SLC51AQ86UW1 340 aa24.92■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 LAMB2P55268 1798 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 YDJCA8MPS7 323 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 WASHC4Q2M389 1173 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 CSRNP1Q96S65 589 aa24.9■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.9■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 PSMD14O00487 310 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 FKBP1BP68106 108 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 EYA3Q99504 573 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-208ENST00000608287 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 SHTN1A0MZ66 631 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 KRT24Q2M2I5 525 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 ADM5C9JUS6 153 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 GNAI1P63096 354 aa24.85■■□□□ 1.57
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