RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600209.5

FCHO1-232, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-232ENST00000600209 FOXO4P98177 505 aa25.15■■□□□ 1.62
FCHO1-232ENST00000600209 STYK1Q6J9G0 422 aa25.15■■□□□ 1.62
FCHO1-232ENST00000600209 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.15■■□□□ 1.62
FCHO1-232ENST00000600209 SUCLG2Q96I99 432 aa25.15■■□□□ 1.62
FCHO1-232ENST00000600209 CTSWP56202 376 aa25.14■■□□□ 1.62
FCHO1-232ENST00000600209 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.14■■□□□ 1.62
FCHO1-232ENST00000600209 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
FCHO1-232ENST00000600209 KAZALD1Q96I82 304 aa25.14■■□□□ 1.62
FCHO1-232ENST00000600209 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.13■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.13■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 PIM2Q9P1W9 311 aa25.13■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 ALDH1B1P30837 517 aa25.12■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 CNKSR1Q969H4 720 aa25.12■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.11■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 GNAI2P04899 355 aa25.1■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.1■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 RTL9Q8NET4 1388 aa25.09■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 TTLL6Q8N841 843 aa25.09■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 TAF1P21675 1872 aa25.09■■□□□ 1.61
FCHO1-232ENST00000600209 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.07■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.07■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 CACNA1SQ13698 1873 aa25.06■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 BBOX1O75936 387 aa25.06■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 GREM2Q9H772 168 aa25.06■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 SLX4Q8IY92 1834 aa25.06■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 GRAPQ13588 217 aa25.05■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 ITGA6P23229 1130 aa25.04■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.04■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.04■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.04■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.03■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.03■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 MTX1Q13505 466 aa25.03■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 FAM161AQ3B820 660 aa25.03■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 CRBNQ96SW2 442 aa25.03■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 TMC4Q7Z404 712 aa25.02■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
FCHO1-232ENST00000600209 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.01■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 BCS1LQ9Y276 419 aa25.01■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 ATP8B2P98198 1209 aa25■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 AAMPQ13685 434 aa25■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 C7orf43Q8WVR3 580 aa25■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.99■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.98■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 SP8Q8IXZ3 490 aa24.98■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.98■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 SOGA3Q5TF21 947 aa24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 SPEF2Q9C093 1822 aa24.96■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 SRGAP3O43295 1099 aa24.96■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.96■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.96■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 COL4A1P02462 1669 aa24.96■■□□□ 1.59
FCHO1-232ENST00000600209 C21orf2O43822 256 aa24.95■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 GPR162Q16538 588 aa24.95■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 CEP85Q6P2H3 762 aa24.95■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.94■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.94■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 SSH3Q8TE77 659 aa24.94■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 POLA2Q14181 598 aa24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 COPRSQ9NQ92 184 aa24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 FBXO3Q9UK99 471 aa24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.92■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 GRIN3BO60391 1043 aa24.92■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC93Q567U6 631 aa24.92■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.92■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.92■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.91■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.91■■□□□ 1.58
FCHO1-232ENST00000600209 HMMRO75330 724 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms