RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 GRM1Q13255 1194 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 SP8Q8IXZ3 490 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 SUPT20HQ8NEM7 779 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 BBOX1O75936 387 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 KIAA2012Q0VF49 1180 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 TCIRG1Q13488 830 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 MPNDQ8N594 471 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 ABHD8Q96I13 439 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 TLL2Q9Y6L7 1015 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 SH3TC1Q8TE82 1336 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 RAD17O75943 681 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 GRAPQ13588 217 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 CIAPIN1Q6FI81 312 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 SCN9AQ15858 1988 aa17.02■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 SHTN1A0MZ66 631 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 YDJCA8MPS7 323 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 AOC2O75106 756 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 ECE1P42892 770 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 LMOD3Q0VAK6 560 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 NEUROD2Q15784 382 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 TRPM4Q8TD43 1214 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 CHL1O00533 1208 aa17■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 CELF2O95319 508 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 PGAP2Q9UHJ9 254 aa17■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 CDHR2Q9BYE9 1310 aa16.99■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 RALBP1Q15311 655 aa16.99■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.99■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 BCL2L13Q9BXK5 485 aa16.99■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 TSKSQ9UJT2 592 aa16.99■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.99■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 TNIP1Q15025 636 aa16.97■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 PLBD2Q8NHP8 589 aa16.97■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 FAM89AQ96GI7 184 aa16.97■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 BEGAINQ9BUH8 593 aa16.97■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 PSME4Q14997 1843 aa16.97■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa16.96■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 MAP2K2P36507 400 aa16.96■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 RGS19P49795 217 aa16.96■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa16.96■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 DLK2Q6UY11 383 aa16.96■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 ISCA1Q9BUE6 129 aa16.96■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.96■□□□□ 0.31
FCHO1-220ENST00000597474 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.95■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa16.95■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 TMC4Q7Z404 712 aa16.95■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 MICALL2Q8IY33 904 aa16.95■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.95■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 PSMD14O00487 310 aa16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 EGFRP00533 1210 aa16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 CDC37L1Q7L3B6 337 aa16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 HHIPL1Q96JK4 782 aa16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 POLLQ9UGP5 575 aa16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 SPEF2Q9C093 1822 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 H7C1D1 291 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 RIMBP2O15034 1052 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 HOXB7P09629 217 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 GPSM2P81274 684 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 WASHC4Q2M389 1173 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 USP48Q86UV5 1035 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 RUNDC1Q96C34 613 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 ZIC5Q96T25 663 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 KCNQ5Q9NR82 932 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 RTL9Q8NET4 1388 aa16.92■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 DPF2Q92785 391 aa16.92■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 MYH3P11055 1940 aa16.92■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 C6orf229H3BNL8 230 aa16.91■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 ECE2O60344 883 aa16.91■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.91■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.91■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
FCHO1-220ENST00000597474 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms