RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, human

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRS-209	ENST00000591760	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	TAF1	P21675	1872 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	VAMP4	O75379	141 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	POTEC	B2RU33	542 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	FZD9	O00144	591 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	G2E3	Q7L622	706 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	FLII	Q13045	1269 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	SCN4A	P35499	1836 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	VPS33B	Q9H267	617 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	COL4A5	P29400	1685 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	APLP1	P51693	650 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	MPND	Q8N594	471 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	PPIP5K2	O43314	1243 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	IGKV5-2	P06315	115 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	PDE8A	O60658	829 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	GPC2	Q8N158	579 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	AOC3	Q16853	763 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	COL4A1	P02462	1669 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
PTPRS-209	ENST00000591760	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	MYH3	P11055	1940 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	LTBP1	Q14766	1721 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760		E9PSI1	815 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	CTSW	P56202	376 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	LINS1	Q8NG48	757 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
PTPRS-209	ENST00000591760	GCKR	Q14397	625 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	CHADL	Q6NUI6	762 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760		H7C1W4	665 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	EPHX2	P34913	555 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	LDHD	Q86WU2	507 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	GPSM2	P81274	684 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	POTEI	P0CG38	1075 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	POTEJ	P0CG39	1038 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	WASHC4	Q2M389	1173 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	RTL9	Q8NET4	1388 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PTPRS-209	ENST00000591760	C6orf229	H3BNL8	230 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	EYA3	Q99504	573 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760		F6X3S4	739 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	POLL	Q9UGP5	575 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	SCNN1D	P51172	638 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	CXCL9	Q07325	125 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	SLFN5	Q08AF3	891 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	SPEF2	Q9C093	1822 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	GREM2	Q9H772	168 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	CASP7	P55210	303 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	TNIP1	Q15025	636 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	UFL1	O94874	794 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	HTRA3	P83110	453 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	GGA1	Q9UJY5	639 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PTPRS-209	ENST00000591760	XDH	P47989	1333 aa		32.7	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	RIMBP2	O15034	1052 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	RAD17	O75943	681 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	YDJC	A8MPS7	323 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	EPS15	P42566	896 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82

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