RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CHPF2Q9P2E5 772 aa33.55■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA2012Q0VF49 1180 aa33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM35Q9UPQ4 493 aa33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 THSD7BQ9C0I4 1608 aa33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPNS2Q96L46 248 aa33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CIAPIN1Q6FI81 312 aa33.51■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4F22Q6NT55 531 aa33.51■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 DUOX1Q9NRD9 1551 aa33.51■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD17O75943 681 aa33.5■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TLL2Q9Y6L7 1015 aa33.5■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 GRM1Q13255 1194 aa33.49■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ECE1P42892 770 aa33.48■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa33.48■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 PLBD2Q8NHP8 589 aa33.48■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 RUNDC1Q96C34 613 aa33.48■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 YDJCA8MPS7 323 aa33.47■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CDHR2Q9BYE9 1310 aa33.47■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL2L13Q9BXK5 485 aa33.46■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC37AA6NMS7 1700 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TNIP1Q15025 636 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ISCA1Q9BUE6 129 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 PGAP2Q9UHJ9 254 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF1P21675 1872 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPM7Q96QT4 1865 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SHTN1A0MZ66 631 aa33.44■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXB7P09629 217 aa33.44■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa33.44■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TMC4Q7Z404 712 aa33.44■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPM4Q8TD43 1214 aa33.44■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM89AQ96GI7 184 aa33.44■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CELF2O95319 508 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 COL4A1P02462 1669 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SAPCD2Q86UD0 394 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS8Q9UP79 889 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 AOC2O75106 756 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-211ENST00000590874 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP27Q5VZP5 1158 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 MICALL2Q8IY33 904 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP44Q96MT7 982 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 BEGAINQ9BUH8 593 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 WASHC4Q2M389 1173 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD8Q96I13 439 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF408Q9H9D4 720 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 HYPKQ9NX55 129 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 GPSM2P81274 684 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 DBNDD1Q9H9R9 158 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 MBIPQ9NS73 344 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD14O00487 310 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP2K2P36507 400 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC37L1Q7L3B6 337 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 POLLQ9UGP5 575 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 TSKSQ9UJT2 592 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C1D1 291 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 RIMBP2O15034 1052 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 HHIPL1Q96JK4 782 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf229H3BNL8 230 aa33.32■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD7Q7Z3H4 446 aa33.32■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 DPF2Q92785 391 aa33.32■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 DLK2Q6UY11 383 aa33.31■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 EGFRP00533 1210 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF853P0CG23 659 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 USP48Q86UV5 1035 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNQ5Q9NR82 932 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 RTL9Q8NET4 1388 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ECE2O60344 883 aa33.29■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 DOK7Q18PE1 504 aa33.29■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 RIC3Q7Z5B4 369 aa33.28■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D16Q8TBP0 767 aa33.28■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS8P62241 208 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 EYA3Q99504 573 aa33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-211ENST00000590874 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA2Q08379 1002 aa33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC31BQ9NQW1 1179 aa33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-211ENST00000590874 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.4 ms