RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 SLC51AQ86UW1 340 aa25.9■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.9■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 SCN4AP35499 1836 aa25.9■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 APLP1P51693 650 aa25.89■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 G2E3Q7L622 706 aa25.89■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 MPNDQ8N594 471 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF521Q96K83 1311 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 IGKV5-2P06315 115 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 FLIIQ13045 1269 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 COL4A5P29400 1685 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 PDE8AO60658 829 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 GPC2Q8N158 579 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.84■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 PPIP5K2O43314 1243 aa25.83■■□□□ 1.73
GIPC1-211ENST00000589631 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 AOC3Q16853 763 aa25.82■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 NIM1KQ8IY84 436 aa25.82■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.81■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 CCER2I3L3R5 266 aa25.81■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.81■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.8■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 HACL1Q9UJ83 578 aa25.8■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 MYH3P11055 1940 aa25.79■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.79■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 COL4A1P02462 1669 aa25.78■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 H7C1W4 665 aa25.78■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 CHADLQ6NUI6 762 aa25.78■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.78■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.78■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 CEP350Q5VT06 3117 aa25.77■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 LINS1Q8NG48 757 aa25.77■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.77■■□□□ 1.72
GIPC1-211ENST00000589631 EPHX2P34913 555 aa25.76■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 GCKRQ14397 625 aa25.76■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 LDHDQ86WU2 507 aa25.76■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.76■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.76■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 POTEIP0CG38 1075 aa25.75■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 POTEJP0CG39 1038 aa25.75■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 CTSWP56202 376 aa25.75■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 GPSM2P81274 684 aa25.74■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.74■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 LTBP1Q14766 1721 aa25.74■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 E9PSI1 815 aa25.73■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 CXCL9Q07325 125 aa25.73■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 WASHC4Q2M389 1173 aa25.73■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.73■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.73■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 POLLQ9UGP5 575 aa25.73■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.72■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.72■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.72■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 RTL9Q8NET4 1388 aa25.71■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 C6orf229H3BNL8 230 aa25.71■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 SCNN1DP51172 638 aa25.71■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 EYA3Q99504 573 aa25.71■■□□□ 1.71
GIPC1-211ENST00000589631 CASP7P55210 303 aa25.7■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 SLFN5Q08AF3 891 aa25.7■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 TNIP1Q15025 636 aa25.7■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.7■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.7■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 F6X3S4 739 aa25.69■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 HTRA3P83110 453 aa25.69■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 BEND3Q5T5X7 828 aa25.69■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 EPS15P42566 896 aa25.68■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 GREM2Q9H772 168 aa25.68■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.68■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 YDJCA8MPS7 323 aa25.67■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.67■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.67■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 RIMBP2O15034 1052 aa25.66■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 CSF1RP07333 972 aa25.66■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 GGA1Q9UJY5 639 aa25.66■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 RAD17O75943 681 aa25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107 ms