RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 JDP2Q8WYK2 163 aa24.03■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 RRAGCQ9HB90 399 aa24.03■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.03■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 F6X3S4 739 aa24.02■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 GCKRQ14397 625 aa24.02■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.02■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.02■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 CACNA1FO60840 1977 aa24.02■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.01■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 MPNDQ8N594 471 aa24.01■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.01■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 H7C1W4 665 aa23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 KIF3CO14782 793 aa23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 PPIP5K2O43314 1243 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 CTSWP56202 376 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 LAMB2P55268 1798 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 BEND3Q5T5X7 828 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 VPS33BQ9H267 617 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 PTPRCP08575 1304 aa23.95■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 TOMM70O94826 608 aa23.95■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 NIM1KQ8IY84 436 aa23.95■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.95■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 SLC51AQ86UW1 340 aa23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 C6orf229H3BNL8 230 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 ALDH1L1O75891 902 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 AOC3Q16853 763 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 FZD9O00144 591 aa23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 GREM2Q9H772 168 aa23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 GRM8O00222 908 aa23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 EYA3Q99504 573 aa23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 SNED1Q8TER0 1413 aa23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-210ENST00000589497 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.89■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 GPSM2P81274 684 aa23.89■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 WASHC4Q2M389 1173 aa23.89■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 TAF1P21675 1872 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 G3V3G9 751 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 CASP7P55210 303 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 GPC2Q8N158 579 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 RIMBP2O15034 1052 aa23.87■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 ITGA6P23229 1130 aa23.87■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.87■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.87■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.86■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 GGA1Q9UJY5 639 aa23.86■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 CSF1RP07333 972 aa23.85■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 FAM161AQ3B820 660 aa23.85■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.85■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 POLLQ9UGP5 575 aa23.85■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 RTL9Q8NET4 1388 aa23.84■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 UFL1O94874 794 aa23.84■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.84■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.84■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.84■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 POTECB2RU33 542 aa23.83■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 FSTL1Q12841 308 aa23.83■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.83■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms