RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GIPC1-210ENST00000589497 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.03■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 F6X3S4 739 aa24.02■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 GCKRQ14397 625 aa24.02■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.02■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.02■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 CACNA1FO60840 1977 aa24.02■■□□□ 1.43
GIPC1-210ENST00000589497 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
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GIPC1-210ENST00000589497 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
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GIPC1-210ENST00000589497 C6orf229H3BNL8 230 aa23.93■■□□□ 1.42
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GIPC1-210ENST00000589497 POTECB2RU33 542 aa23.83■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 FSTL1Q12841 308 aa23.83■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.83■■□□□ 1.41
GIPC1-210ENST00000589497 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.83■■□□□ 1.41
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