RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 BEND3Q5T5X7 828 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 LINS1Q8NG48 757 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 BCAR3O75815 825 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 BBOX1O75936 387 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 MYH3P11055 1940 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC4O15439 1325 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRCP08575 1304 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 NFKBIEO00221 500 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 PRELPP51888 382 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC93Q567U6 631 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 SOGA3Q5TF21 947 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC51AQ86UW1 340 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF181Q9P0P0 153 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CDHR2Q9BYE9 1310 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 ALDH1L1O75891 902 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 LMNB1P20700 586 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CASP7P55210 303 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS8P62241 208 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 GRAPQ13588 217 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 SP8Q8IXZ3 490 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 SPEF2Q9C093 1822 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 GRM8O00222 908 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 MPNDQ8N594 471 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 GREM2Q9H772 168 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.037e-7■■■□□ 14.9
EFTUD2-211ENST00000588374 CTSWP56202 376 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXO4P98177 505 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 TNNQ9UQP3 1299 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 COL4A1P02462 1669 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 PITPNM1O00562 1244 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 CSF1RP07333 972 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 SUCLG2Q96I99 432 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 PLA2G12BQ9BX93 195 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 USP44Q9H0E7 712 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF16BQ96L93 1317 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 C6orf229H3BNL8 230 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 RIMBP2O15034 1052 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGA6P23229 1130 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 GPSM2P81274 684 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 TMC4Q7Z404 712 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMD1Q99460 953 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 RRAGCQ9HB90 399 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM27P14373 513 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms