RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		31.41	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	PLIN1	O60240	522 aa		31.4	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	C21orf2	O43822	256 aa		31.39	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	GRIN3B	O60391	1043 aa		31.39	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		31.39	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		31.39	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	CHD4	Q14839	1912 aa		31.39	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		31.38	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		31.38	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		31.37	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	SUCLG2	Q96I99	432 aa		31.37	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.37	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	USP44	Q9H0E7	712 aa		31.37	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		31.36	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	COL4A1	P02462	1669 aa		31.36	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	GRAP	Q13588	217 aa		31.36	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.36	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	UTY	O14607	1347 aa		31.35	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	MS4A1	P11836	297 aa		31.35	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	PANK1	Q8TE04	598 aa		31.35	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	GREM2	Q9H772	168 aa		31.35	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		31.35	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	RLBP1	P12271	317 aa		31.34	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	FAM161A	Q3B820	660 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	MEIS3	Q99687	375 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GPS1-223	ENST00000584229	FOXO4	P98177	505 aa		31.32	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		31.32	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	SOGA3	Q5TF21	947 aa		31.32	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		31.32	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	OLFM4	Q6UX06	510 aa		31.31	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		31.31	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	SBF1	O95248	1867 aa		31.3	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC93	Q567U6	631 aa		31.3	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	BBOX1	O75936	387 aa		31.29	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	GNAI3	P08754	354 aa		31.29	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	ITGA6	P23229	1130 aa		31.29	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		31.29	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	RASSF7	Q02833	373 aa		31.28	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	SLC51A	Q86UW1	340 aa		31.28	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	RTL9	Q8NET4	1388 aa		31.28	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		31.27	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	CSF1R	P07333	972 aa		31.27	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		31.27	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	KAZALD1	Q96I82	304 aa		31.27	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		31.27	■■■□□ 2.6
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		31.26	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		31.26	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	TMC4	Q7Z404	712 aa		31.25	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		31.25	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	COG6	Q9Y2V7	657 aa		31.25	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		31.23	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		31.23	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	SP8	Q8IXZ3	490 aa		31.23	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		31.23	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		31.23	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		31.23	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		31.22	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		31.22	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GUL6	1792 aa		31.22	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	GNAI2	P04899	355 aa		31.21	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	UTRN	P46939	3433 aa		31.2	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	NFKBIE	O00221	500 aa		31.2	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
GPS1-223	ENST00000584229	PDE3A	Q14432	1141 aa		31.19	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		31.19	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	31.18	■■■□□ 2.58	1e-6	■■□□□ 11.7
GPS1-223	ENST00000584229	MPND	Q8N594	471 aa		31.18	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		31.18	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		31.17	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	LTBP1	Q14766	1721 aa		31.16	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		31.16	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	RNF181	Q9P0P0	153 aa		31.16	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		31.15	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58

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