RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.92■■■□□ 2.22
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RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM161AQ3B820 660 aa28.92■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 ERFEQ4G0M1 354 aa28.92■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.92■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 STK32BQ9NY57 414 aa28.92■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 SIL1Q9H173 461 aa28.91■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 TM4SF1P30408 202 aa28.9■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC10A5Q5PT55 438 aa28.9■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
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RARA-AS1-201ENST00000581080 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 GREM2Q9H772 168 aa28.9■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 LAMB2P55268 1798 aa28.88■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.88■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 BCL11AQ9H165 835 aa28.88■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 ITGA6P23229 1130 aa28.88■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.88■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 SASH1O94885 1247 aa28.87■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.85■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.85■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABCC12Q96J65 1359 aa28.85■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.85■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXO3Q9UK99 471 aa28.85■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 EYA2O00167 538 aa28.83■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 NPHP1O15259 732 aa28.83■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 CIAO1O76071 339 aa28.83■■■□□ 2.21
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.83■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNBD1Q8NA66 436 aa28.83■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 RTL9Q8NET4 1388 aa28.83■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERPINB2P05120 415 aa28.83■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.83■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.82■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDR1Q08345 913 aa28.82■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 NLRP3Q96P20 1036 aa28.82■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRC24Q50LG9 513 aa28.8■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.8■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.8■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.8■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.8■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 TFCP2Q12800 502 aa28.78■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa28.78■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 OSBPL3Q9H4L5 887 aa28.78■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.78■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDE1AP54750 535 aa28.78■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 MX1P20591 662 aa28.77■■■□□ 2.2
RARA-AS1-201ENST00000581080 ST5P78524 1137 aa28.76■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.76■■■□□ 2.19
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RARA-AS1-201ENST00000581080 STAP2Q9UGK3 403 aa28.75■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 AACSQ86V21 672 aa28.75■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 MMP10P09238 476 aa28.74■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.74■■■□□ 2.19
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TNNI3KQ59H18 835 aa28.73■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.73■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 MSL1Q68DK7 614 aa28.73■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.73■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.73■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPR108Q9NPR9 543 aa28.73■■■□□ 2.19
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RARA-AS1-201ENST00000581080 LRP5O75197 1615 aa28.72■■■□□ 2.19
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RARA-AS1-201ENST00000581080 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.7■■■□□ 2.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 AOX1Q06278 1338 aa28.7■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.69■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.69■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.69■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRY2Q49AN0 593 aa28.68■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 METTL24Q5JXM2 366 aa28.68■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.68■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 C8orf34Q49A92 452 aa28.67■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.67■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.67■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPATCH3Q96I76 525 aa28.67■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.67■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.67■■■□□ 2.18
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