RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 GP2P55259 537 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 LARGE2Q8N3Y3 721 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1024Q9UPX6 916 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 ATAD2Q6PL18 1390 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 F8W735 103 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 C21orf2O43822 256 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN10P78369 228 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 GPLD1P80108 840 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 RTN1Q16799 776 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 MAP4K3Q8IVH8 894 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 WWC1Q8IX03 1113 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 MED26O95402 600 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV1-40P01703 118 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 PLAURQ03405 335 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZS46 218 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 SIX5Q8N196 739 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 BCL11AQ9H165 835 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 RAXQ9Y2V3 346 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 USP17L3A6NCW0 530 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 USP17L4A6NCW7 530 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 ALX3O95076 343 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 INPP5BP32019 993 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 NRLP54845 237 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 USP17L2Q6R6M4 530 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 USP17L1Q7RTZ2 530 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 OGFOD1Q8N543 542 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 NGLY1Q96IV0 654 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 ZFATQ9P243 1243 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 STOML1Q9UBI4 398 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 GRIK1P39086 918 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 BCS1LQ9Y276 419 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 TGFB1P01137 390 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 RARAP10276 462 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 GLB1P16278 677 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 IDH3AP50213 366 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 MCM6Q14566 821 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 C14orf37Q86TY3 774 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 IFT43Q96FT9 208 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 COG6Q9Y2V7 657 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-204ENST00000577468 SASH3O75995 380 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRM-204ENST00000577468 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 SPINK2P20155 84 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 ARSDP51689 593 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 IL22RA1Q8N6P7 574 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 PLD4Q96BZ4 506 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 MUC3BQ9H195 1237 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 ATP9BO43861 1147 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 WNT11O96014 354 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 SEC13P55735 322 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 SIK1P57059 783 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 NFIAQ12857 509 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 SETDB1Q15047 1291 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 DTX1Q86Y01 620 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 CEP41Q9BYV8 373 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 ADAMTS4O75173 837 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 EGFRP00533 1210 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM132AQ24JP5 1023 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 UVSSAQ2YD98 709 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 RNF43Q68DV7 783 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 RBSNQ9H1K0 784 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 MICAL2O94851 1124 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 GHRHP01286 108 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 PSAPP07602 524 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 IGFBP4P22692 258 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 DBNDD2Q9BQY9 259 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 KLK14Q9P0G3 267 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 J3QW42 95 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 RASA1P20936 1047 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 SOX18P35713 384 aa4.73□□□□□ -1.65
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