RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF428Q96B54 188 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 ABHD8Q96I13 439 aa20.27■□□□□ 0.84
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SPNS2-208ENST00000576635 TCIRG1Q13488 830 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 KRT24Q2M2I5 525 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 COL4A1P02462 1669 aa20.26■□□□□ 0.83
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SPNS2-208ENST00000576635 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.25■□□□□ 0.83
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SPNS2-208ENST00000576635 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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SPNS2-208ENST00000576635 YDJCA8MPS7 323 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 TSKSQ9UJT2 592 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 SHTN1A0MZ66 631 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 NEUROD2Q15784 382 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 TNIP1Q15025 636 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 CHL1O00533 1208 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 MAP2K2P36507 400 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 RALBP1Q15311 655 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS2-208ENST00000576635 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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SPNS2-208ENST00000576635 MICALL2Q8IY33 904 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.19■□□□□ 0.82
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SPNS2-208ENST00000576635 FAM161AQ3B820 660 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 FAM89AQ96GI7 184 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.17■□□□□ 0.82
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SPNS2-208ENST00000576635 WASHC4Q2M389 1173 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 DLK2Q6UY11 383 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 PSMD14O00487 310 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 RIMBP2O15034 1052 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 GPSM2P81274 684 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 USP48Q86UV5 1035 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 POLLQ9UGP5 575 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-208ENST00000576635 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 C6orf229H3BNL8 230 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 CA12O43570 354 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 EGFRP00533 1210 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 HOXB7P09629 217 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 DPF2Q92785 391 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 RUNDC1Q96C34 613 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 ZIC5Q96T25 663 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 RTL9Q8NET4 1388 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 ECE2O60344 883 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 PSME4Q14997 1843 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 HUNKP57058 714 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 DOK7Q18PE1 504 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 NOGQ13253 232 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 HYPKQ9NX55 129 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS2-208ENST00000576635 CFAP44Q96MT7 982 aa20.1■□□□□ 0.81
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