RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 ATP8B2P98198 1209 aa23.93■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.93■■□□□ 1.42
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CTU2-204ENST00000564105 ST5P78524 1137 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 CHD4Q14839 1912 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 KLHL34Q8N239 644 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 MTX1Q13505 466 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.91■■□□□ 1.42
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CTU2-204ENST00000564105 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 SRGAP3O43295 1099 aa23.89■■□□□ 1.41
CTU2-204ENST00000564105 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CTU2-204ENST00000564105 HMMRO75330 724 aa23.88■■□□□ 1.41
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CTU2-204ENST00000564105 NLRP3Q96P20 1036 aa23.88■■□□□ 1.41
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CTU2-204ENST00000564105 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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CTU2-204ENST00000564105 IGHDP01880 384 aa23.86■■□□□ 1.41
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CTU2-204ENST00000564105 A0A1B0GUL6 1792 aa23.84■■□□□ 1.41
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CTU2-204ENST00000564105 GREM2Q9H772 168 aa23.84■■□□□ 1.41
CTU2-204ENST00000564105 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.83■■□□□ 1.41
CTU2-204ENST00000564105 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
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CTU2-204ENST00000564105 RTL9Q8NET4 1388 aa23.82■■□□□ 1.4
CTU2-204ENST00000564105 ITGA6P23229 1130 aa23.82■■□□□ 1.4
CTU2-204ENST00000564105 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.81■■□□□ 1.4
CTU2-204ENST00000564105 GPR162Q16538 588 aa23.81■■□□□ 1.4
CTU2-204ENST00000564105 COL4A1P02462 1669 aa23.8■■□□□ 1.4
CTU2-204ENST00000564105 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.8■■□□□ 1.4
CTU2-204ENST00000564105 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.8■■□□□ 1.4
CTU2-204ENST00000564105 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.8■■□□□ 1.4
CTU2-204ENST00000564105 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
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CTU2-204ENST00000564105 GCC1Q96CN9 775 aa23.77■■□□□ 1.4
CTU2-204ENST00000564105 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.77■■□□□ 1.4
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CTU2-204ENST00000564105 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
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CTU2-204ENST00000564105 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.75■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
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CTU2-204ENST00000564105 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
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CTU2-204ENST00000564105 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 H0YIN7 160 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 EYA2O00167 538 aa23.72■■□□□ 1.39
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CTU2-204ENST00000564105 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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CTU2-204ENST00000564105 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 FBXO3Q9UK99 471 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 RAB11FIP3O75154 756 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 GRAPQ13588 217 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 LRRC24Q50LG9 513 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CTU2-204ENST00000564105 MASTLQ96GX5 879 aa23.71■■□□□ 1.39
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