RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNED1Q8TER0 1413 aa28.12■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BBOX1O75936 387 aa28.12■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMNB1P20700 586 aa28.12■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.12■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.12■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.11■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.11■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF181Q9P0P0 153 aa28.11■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CASP7P55210 303 aa28.1■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CTSWP56202 376 aa28.1■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMC4Q7Z404 712 aa28.1■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.1■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OLFM4Q6UX06 510 aa28.09■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.09■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRM8O00222 908 aa28.08■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.08■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAF1P21675 1872 aa28.08■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.07■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.07■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRELPP51888 382 aa28.07■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTL9Q8NET4 1388 aa28.07■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SP8Q8IXZ3 490 aa28.06■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSMD1Q99460 953 aa28.06■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.05■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.05■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL4A1P02462 1669 aa28.04■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.03■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UTYO14607 1347 aa28.01■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCAR3O75815 825 aa28.01■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC51AQ86UW1 340 aa28.01■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CSF1RP07333 972 aa28■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GREM2Q9H772 168 aa28■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.99■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MPNDQ8N594 471 aa27.98■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SUPT20HQ8NEM7 779 aa27.98■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOXO4P98177 505 aa27.97■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM161AQ3B820 660 aa27.97■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.96■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.96■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM27P14373 513 aa27.95■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGA6P23229 1130 aa27.95■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LTBP1Q14766 1721 aa27.95■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPEF2Q9C093 1822 aa27.95■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.94■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SUCLG2Q96I99 432 aa27.94■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP44Q9H0E7 712 aa27.94■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VPS33BQ9H267 617 aa27.94■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.93■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.93■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.93■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.92■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.92■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 JDP2Q8WYK2 163 aa27.91■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KAZALD1Q96I82 304 aa27.91■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPIP5K2O43314 1243 aa27.9■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPSM2P81274 684 aa27.9■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27.9■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.9■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL4A5P29400 1685 aa27.89■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GLTPD2A6NH11 291 aa27.89■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.89■■■□□ 2.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AOC3Q16853 763 aa27.88■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.88■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.88■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 XDHP47989 1333 aa27.88■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.87■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NIM1KQ8IY84 436 aa27.87■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.87■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.87■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNNQ9UQP3 1299 aa27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms