RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561983.5

RHOT2-204, Transcript of ras homolog family member T2, human

TSL 5

Gene RHOT2, Length 1,044 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT2-204	ENST00000561983	GPC2	Q8N158	579 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RHOT2-204	ENST00000561983	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RHOT2-204	ENST00000561983	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RHOT2-204	ENST00000561983	SLC51A	Q86UW1	340 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RHOT2-204	ENST00000561983	NIM1K	Q8IY84	436 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RHOT2-204	ENST00000561983	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
RHOT2-204	ENST00000561983	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	HACL1	Q9UJ83	578 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	CHADL	Q6NUI6	762 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	AOC3	Q16853	763 aa		31.42	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	SCN4A	P35499	1836 aa		31.41	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	HTRA3	P83110	453 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	LDHD	Q86WU2	507 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RHOT2-204	ENST00000561983	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	EPHX2	P34913	555 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	PDE8A	O60658	829 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	POTEI	P0CG38	1075 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	POTEJ	P0CG39	1038 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	TAF1	P21675	1872 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		31.36	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	G2E3	Q7L622	706 aa		31.36	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	VAMP4	O75379	141 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	COL4A5	P29400	1685 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.33	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	FLII	Q13045	1269 aa		31.33	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
RHOT2-204	ENST00000561983	KLRG1	Q96E93	195 aa		31.32	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.31	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	C6orf229	H3BNL8	230 aa		31.31	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	WASHC4	Q2M389	1173 aa		31.31	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		31.31	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		31.29	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	CXCL9	Q07325	125 aa		31.29	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	TNIP1	Q15025	636 aa		31.29	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	GPSM2	P81274	684 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	EYA3	Q99504	573 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RHOT2-204	ENST00000561983	EPS15	P42566	896 aa		31.26	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	SCNN1D	P51172	638 aa		31.26	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		31.26	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		31.26	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	RIMBP2	O15034	1052 aa		31.25	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	CTSW	P56202	376 aa		31.25	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	POLL	Q9UGP5	575 aa		31.25	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983		H7C1W4	665 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	RAD17	O75943	681 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	GCKR	Q14397	625 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	CNTROB	Q8N137	903 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	CREBZF	Q9NS37	354 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.22	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		31.22	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		31.22	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983		G3V3G9	751 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	PASK	Q96RG2	1323 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	JMY	Q8N9B5	988 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	GGA1	Q9UJY5	639 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RHOT2-204	ENST00000561983	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		31.19	■■■□□ 2.58
RHOT2-204	ENST00000561983	UFL1	O94874	794 aa		31.19	■■■□□ 2.58
RHOT2-204	ENST00000561983	YDJC	A8MPS7	323 aa		31.18	■■■□□ 2.58
RHOT2-204	ENST00000561983	COL4A1	P02462	1669 aa		31.18	■■■□□ 2.58

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