RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 PDE8AO60658 829 aa23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 BCAR3O75815 825 aa23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 ALDH1L1O75891 902 aa23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 CTSWP56202 376 aa23.54■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 GRAPQ13588 217 aa23.53■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC93Q567U6 631 aa23.53■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 SOGA3Q5TF21 947 aa23.53■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 LTBP1Q14766 1721 aa23.53■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 GRM8O00222 908 aa23.52■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.52■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.52■■□□□ 1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.51■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.51■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 RTL9Q8NET4 1388 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.49■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 TNNQ9UQP3 1299 aa23.49■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 UTYO14607 1347 aa23.49■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 BBOX1O75936 387 aa23.48■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 TRIM27P14373 513 aa23.48■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 LMNB1P20700 586 aa23.48■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 GREM2Q9H772 168 aa23.48■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 RNF181Q9P0P0 153 aa23.48■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 A0A1B0GUL6 1792 aa23.46■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 COL4A5P29400 1685 aa23.46■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 FOXO4P98177 505 aa23.46■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 FAM161AQ3B820 660 aa23.46■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 CSF1RP07333 972 aa23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 SP8Q8IXZ3 490 aa23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 KAZALD1Q96I82 304 aa23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 SUCLG2Q96I99 432 aa23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP44Q9H0E7 712 aa23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 TMC4Q7Z404 712 aa23.44■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 PSMD1Q99460 953 aa23.44■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 ITGA6P23229 1130 aa23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 GPSM2P81274 684 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 MPNDQ8N594 471 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 MEIS3Q99687 375 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 RLBP1P12271 317 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 AOC3Q16853 763 aa23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 POLLQ9UGP5 575 aa23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPIP5K2O43314 1243 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms