RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
FAM227B-211ENST00000560557 SNRKQ9NRH2 765 aa6.9□□□□□ -1.3
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FAM227B-211ENST00000560557 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 SETDB1Q15047 1291 aa6.89□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 GPLD1P80108 840 aa6.88□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 IRF5Q13568 498 aa6.88□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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FAM227B-211ENST00000560557 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 ZFATQ9P243 1243 aa6.88□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.88□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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FAM227B-211ENST00000560557 PSME1Q06323 249 aa6.86□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 COL19A1Q14993 1142 aa6.86□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.86□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.86□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 CEP41Q9BYV8 373 aa6.86□□□□□ -1.31
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FAM227B-211ENST00000560557 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 WISP1O95388 367 aa6.85□□□□□ -1.31
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FAM227B-211ENST00000560557 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.85□□□□□ -1.31
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FAM227B-211ENST00000560557 EML3Q32P44 896 aa6.84□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.84□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 MYRFLQ96LU7 910 aa6.84□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.84□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 NOD1Q9Y239 953 aa6.84□□□□□ -1.31
FAM227B-211ENST00000560557 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.84□□□□□ -1.31
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FAM227B-211ENST00000560557 IER5Q5VY09 327 aa6.83□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.83□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.83□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.83□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.83□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.83□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 PIK3CDO00329 1044 aa6.82□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 HIF1AQ16665 826 aa6.82□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 IFT43Q96FT9 208 aa6.82□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.82□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 PIM2Q9P1W9 311 aa6.82□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 WDR64B1ANS9 1081 aa6.81□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.81□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.81□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 PLD4Q96BZ4 506 aa6.81□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 PRNPP04156 253 aa6.8□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 NRLP54845 237 aa6.8□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 ACAD11Q709F0 780 aa6.8□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 FBXL18Q96ME1 805 aa6.8□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.79□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 RARAP10276 462 aa6.79□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.79□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 PAPLNO95428 1278 aa6.78□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 BEND4Q6ZU67 534 aa6.78□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.78□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.78□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 BCS1LQ9Y276 419 aa6.78□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 NCANO14594 1321 aa6.77□□□□□ -1.32
FAM227B-211ENST00000560557 J3QW42 95 aa6.77□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 SASH3O75995 380 aa6.77□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 EPB42P16452 691 aa6.77□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.77□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.77□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 TM4SF5O14894 197 aa6.76□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 C21orf2O43822 256 aa6.76□□□□□ -1.33
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FAM227B-211ENST00000560557 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 FOSL1P15407 271 aa6.76□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 SEMA3FQ13275 785 aa6.76□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 NCOA4Q13772 614 aa6.76□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.76□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 COL26A1Q96A83 441 aa6.76□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.76□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 PRRG2O14669 202 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 BMP3P12645 472 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 SKIP12755 728 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 INPP5BP32019 993 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 NGLY1Q96IV0 654 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM227B-211ENST00000560557 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.74□□□□□ -1.33
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