RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.61■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa29.61■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 CSF1RP07333 972 aa29.6■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.6■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 NUCB1Q02818 461 aa29.59■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.59■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 CNBD1Q8NA66 436 aa29.59■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 TTLL11Q8NHH1 800 aa29.59■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.59■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 RAB11FIP3O75154 756 aa29.58■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 SLC10A5Q5PT55 438 aa29.58■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 APBB1O00213 710 aa29.57■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 SERPINB2P05120 415 aa29.57■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.57■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 COPRSQ9NQ92 184 aa29.57■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
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MEIS3-204ENST00000558555 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.56■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
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MEIS3-204ENST00000558555 ABCC12Q96J65 1359 aa29.55■■■□□ 2.32
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MEIS3-204ENST00000558555 ST5P78524 1137 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 DDR1Q08345 913 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 ERC1Q8IUD2 1116 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 LRRCC1Q9C099 1032 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 MSL1Q68DK7 614 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 GREM2Q9H772 168 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.53■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.53■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 NLRP3Q96P20 1036 aa29.53■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 LNPKQ9C0E8 428 aa29.53■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 SIL1Q9H173 461 aa29.53■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 ITGA6P23229 1130 aa29.52■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.52■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 PARP3Q9Y6F1 533 aa29.52■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 MMP10P09238 476 aa29.51■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 KIF1BPQ96EK5 621 aa29.51■■■□□ 2.32
MEIS3-204ENST00000558555 RTL9Q8NET4 1388 aa29.51■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.5■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.5■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 RHPN1Q8TCX5 695 aa29.49■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 RGS3P49796 1198 aa29.48■■■□□ 2.31
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MEIS3-204ENST00000558555 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 SKAP1Q86WV1 359 aa29.48■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 BCL11AQ9H165 835 aa29.48■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 FBXO3Q9UK99 471 aa29.48■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 NRXN2Q9P2S2 1712 aa29.47■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 EYA2O00167 538 aa29.45■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 CIAO1O76071 339 aa29.45■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 C3orf67Q6ZVT6 689 aa29.45■■■□□ 2.31
MEIS3-204ENST00000558555 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 PDE4AP27815 886 aa29.43■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 POLD1P28340 1107 aa29.43■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa29.43■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.42■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 SYT17Q9BSW7 474 aa29.42■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.42■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 SASH1O94885 1247 aa29.42■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 CNNM1Q9NRU3 951 aa29.42■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.41■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 MPHOSPH8Q99549 860 aa29.41■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC24Q50LG9 513 aa29.4■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 KLHL34Q8N239 644 aa29.4■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 BRIP1Q9BX63 1249 aa29.4■■■□□ 2.3
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa29.39■■■□□ 2.3
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MEIS3-204ENST00000558555 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.38■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa29.37■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 PDE6BP35913 854 aa29.36■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 CRY2Q49AN0 593 aa29.36■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa29.36■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 TAF1P21675 1872 aa29.35■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 METTL24Q5JXM2 366 aa29.35■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 AACSQ86V21 672 aa29.34■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.34■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
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