RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 CXCL9Q07325 125 aa21.56■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 TNIP1Q15025 636 aa21.56■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 KRT24Q2M2I5 525 aa21.56■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 MPNDQ8N594 471 aa21.56■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.55■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 LTBP1Q14766 1721 aa21.55■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 CST9Q5W186 159 aa21.55■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 COPS6Q7L5N1 327 aa21.55■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 TMC4Q7Z404 712 aa21.55■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 NLRP10Q86W26 655 aa21.55■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.55■■□□□ 1.04
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NEK9-211ENST00000557673 MAP2K2P36507 400 aa21.54■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.54■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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NEK9-211ENST00000557673 PROSER3Q2NL68 480 aa21.54■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.54■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 NECTIN2Q92692 538 aa21.54■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.54■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 ANXA1P04083 346 aa21.53■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 GRM1Q13255 1194 aa21.53■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.53■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 SLC51AQ86UW1 340 aa21.53■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.53■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.53■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
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NEK9-211ENST00000557673 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEK9-211ENST00000557673 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 ABHD8Q96I13 439 aa21.51■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.51■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 CFAP44Q96MT7 982 aa21.51■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.51■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 CA12O43570 354 aa21.5■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.5■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.49■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 RAD17O75943 681 aa21.49■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 CCDC27Q2M243 656 aa21.49■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 MBIPQ9NS73 344 aa21.49■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 H7C1D1 291 aa21.48■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.48■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 ZNF853P0CG23 659 aa21.47■■□□□ 1.03
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NEK9-211ENST00000557673 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.46■■□□□ 1.03
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NEK9-211ENST00000557673 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.46■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.46■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 IFT57Q9NWB7 429 aa21.46■■□□□ 1.03
NEK9-211ENST00000557673 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.46■■□□□ 1.03
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NEK9-211ENST00000557673 WWC1Q8IX03 1113 aa21.45■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 DPF2Q92785 391 aa21.45■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 AOC2O75106 756 aa21.44■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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NEK9-211ENST00000557673 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.44■■□□□ 1.02
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NEK9-211ENST00000557673 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.43■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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NEK9-211ENST00000557673 HYPKQ9NX55 129 aa21.42■■□□□ 1.02
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NEK9-211ENST00000557673 ZNF521Q96K83 1311 aa21.41■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 C6orf229H3BNL8 230 aa21.41■■□□□ 1.02
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NEK9-211ENST00000557673 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 NOGQ13253 232 aa21.41■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 FAM89AQ96GI7 184 aa21.41■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.41■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 IL16Q14005 1332 aa21.4■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.4■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEK9-211ENST00000557673 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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NEK9-211ENST00000557673 PSMD14O00487 310 aa21.39■■□□□ 1.01
NEK9-211ENST00000557673 FAM161AQ3B820 660 aa21.39■■□□□ 1.01
NEK9-211ENST00000557673 USP48Q86UV5 1035 aa21.39■■□□□ 1.01
NEK9-211ENST00000557673 TSKSQ9UJT2 592 aa21.39■■□□□ 1.01
NEK9-211ENST00000557673 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NEK9-211ENST00000557673 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.38■■□□□ 1.01
NEK9-211ENST00000557673 HUNKP57058 714 aa21.38■■□□□ 1.01
NEK9-211ENST00000557673 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.38■■□□□ 1.01
NEK9-211ENST00000557673 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.38■■□□□ 1.01
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