RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 SLC4A2P04920 1241 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 CACNA1SQ13698 1873 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 HACL1Q9UJ83 578 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 PPIP5K2O43314 1243 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 PDE8AO60658 829 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.39■■□□□ 1.18
NEDD1-212ENST00000557478 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 CHADLQ6NUI6 762 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 LDHDQ86WU2 507 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 VAMP4O75379 141 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 FLIIQ13045 1269 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 EYA3Q99504 573 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 TNIP1Q15025 636 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 SCN4AP35499 1836 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 EPHX2P34913 555 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 AOC3Q16853 763 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 LINS1Q8NG48 757 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-212ENST00000557478 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 CCER2I3L3R5 266 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 IGKV5-2P06315 115 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 WASHC4Q2M389 1173 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF428Q96B54 188 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 E9PSI1 815 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 CTSWP56202 376 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF521Q96K83 1311 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 RTL9Q8NET4 1388 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 H7C1W4 665 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 GCKRQ14397 625 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 KLRG1Q96E93 195 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 LAMB2P55268 1798 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 C6orf229H3BNL8 230 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 G2E3Q7L622 706 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 CREBZFQ9NS37 354 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 CXCL9Q07325 125 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 GGA1Q9UJY5 639 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-212ENST00000557478 CACNA1FO60840 1977 aa22.27■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 SCNN1DP51172 638 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 GPSM2P81274 684 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 XDHP47989 1333 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 G3V3G9 751 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 JMYQ8N9B5 988 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 DPF2Q92785 391 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 POLLQ9UGP5 575 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 COL4A5P29400 1685 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 ATP2B4P23634 1241 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 PASKQ96RG2 1323 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 UFL1O94874 794 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 CNTROBQ8N137 903 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 H7C1D1 291 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 ALDH1L1O75891 902 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 POTEIP0CG38 1075 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms