RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557400.5

NEDD1-210, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 604 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-210ENST00000557400 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-210ENST00000557400 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-210ENST00000557400 ECE1P42892 770 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-210ENST00000557400 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-210ENST00000557400 CST9Q5W186 159 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-210ENST00000557400 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-210ENST00000557400 CAPNS2Q96L46 248 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-210ENST00000557400 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-210ENST00000557400 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 TMC4Q7Z404 712 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 TNIP1Q15025 636 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 RUNDC1Q96C34 613 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 RAD17O75943 681 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 HOXB7P09629 217 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 GRM1Q13255 1194 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 ZNF428Q96B54 188 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-210ENST00000557400 YDJCA8MPS7 323 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 FAM89AQ96GI7 184 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 HYPKQ9NX55 129 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 MAP2K2P36507 400 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 CFAP44Q96MT7 982 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 LAMB2P55268 1798 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 H7C1D1 291 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 WASHC4Q2M389 1173 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 MICALL2Q8IY33 904 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 DPF2Q92785 391 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 ABHD8Q96I13 439 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 SHTN1A0MZ66 631 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 AOC2O75106 756 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-210ENST00000557400 C6orf229H3BNL8 230 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 PSMD14O00487 310 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 MBIPQ9NS73 344 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 GPSM2P81274 684 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 POLLQ9UGP5 575 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 RIMBP2O15034 1052 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 CA12O43570 354 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 GOLGA2Q08379 1002 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 EYA3Q99504 573 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 ZNF853P0CG23 659 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 USP48Q86UV5 1035 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 ECE2O60344 883 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 TSKSQ9UJT2 592 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 DOK7Q18PE1 504 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 IFT57Q9NWB7 429 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 RTL9Q8NET4 1388 aa22.14■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 COL4A1P02462 1669 aa22.14■■□□□ 1.14
NEDD1-210ENST00000557400 EGFRP00533 1210 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.14■■□□□ 1.13
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