RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551219.5

PTPRR-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRR, Length 2,966 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-211ENST00000551219 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 JCADQ9P266 1359 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 AP5Z1O43299 807 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 TTC6Q86TZ1 520 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 TNMDQ9H2S6 317 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 PYGBP11216 843 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 KCNJ4P48050 445 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 NUBP1P53384 320 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 FEZ1Q99689 392 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 SMTNL1A8MU46 457 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 SLC27A2O14975 620 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 CPA1P15085 419 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 KRT32Q14532 448 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 MRC1P22897 1456 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRR-211ENST00000551219 NEMFO60524 1076 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 RPS6KB1P23443 525 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 LTKP29376 864 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 MPNDQ8N594 471 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 SPC24Q8NBT2 197 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 SPATA32Q96LK8 384 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 TSPOAP1O95153 1857 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 UTYO14607 1347 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 MED23Q9ULK4 1368 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 PTGS1P23219 599 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 ZNF75DP51815 510 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 AACSQ86V21 672 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 CBX8Q9HC52 389 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 KIF20AO95235 890 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 LIG1P18858 919 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 KSR2Q6VAB6 950 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 NECAB1Q8N987 351 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 IP6K1Q92551 441 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 CTAGE5O15320 804 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 TEFQ10587 303 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 SARM1Q6SZW1 724 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 DACT1Q9NYF0 836 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 TCHHQ07283 1943 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 LUZP1Q86V48 1076 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 BTBD11A6QL63 1104 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 DRC7Q8IY82 874 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 LINS1Q8NG48 757 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 TSC1Q92574 1164 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 TRIM5Q9C035 493 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 CFAP45Q9UL16 551 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 NFAT5O94916 1531 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 ATL3Q6DD88 541 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 ABTB2Q8N961 1025 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 FSD1Q9BTV5 496 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 GRM8O00222 908 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 ZNF165P49910 485 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 RESTQ13127 1097 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-211ENST00000551219 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms