RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRQ-204ENST00000549355 NFKB1P19838 968 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRQ-204ENST00000549355 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRQ-204ENST00000549355 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRQ-204ENST00000549355 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
PTPRQ-204ENST00000549355 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRQ-204ENST00000549355 SETDB1Q15047 1291 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRQ-204ENST00000549355 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRQ-204ENST00000549355 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRQ-204ENST00000549355 MAP3K6O95382 1288 aa8.08□□□□□ -1.12
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PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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PTPRQ-204ENST00000549355 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRQ-204ENST00000549355 ZFATQ9P243 1243 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRQ-204ENST00000549355 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRQ-204ENST00000549355 TM4SF5O14894 197 aa8.04□□□□□ -1.12
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PTPRQ-204ENST00000549355 UVSSAQ2YD98 709 aa8.04□□□□□ -1.12
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PTPRQ-204ENST00000549355 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRQ-204ENST00000549355 PAPLNO95428 1278 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRQ-204ENST00000549355 IRF5Q13568 498 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRQ-204ENST00000549355 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
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PTPRQ-204ENST00000549355 PNMA5Q96PV4 448 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRQ-204ENST00000549355 PRRG2O14669 202 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRQ-204ENST00000549355 GALNT11Q8NCW6 608 aa8□□□□□ -1.13
PTPRQ-204ENST00000549355 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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PTPRQ-204ENST00000549355 CEP41Q9BYV8 373 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRQ-204ENST00000549355 IER5Q5VY09 327 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRQ-204ENST00000549355 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRQ-204ENST00000549355 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 CUX2O14529 1486 aa7.95□□□□□ -1.14
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PTPRQ-204ENST00000549355 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.95□□□□□ -1.14
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PTPRQ-204ENST00000549355 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 BEND4Q6ZU67 534 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 B8ZZF3 427 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 PIK3CDO00329 1044 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 C21orf2O43822 256 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 ACAD11Q709F0 780 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 JAG2Q9Y219 1238 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 INPP5BP32019 993 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRQ-204ENST00000549355 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.9□□□□□ -1.14
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