RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 SASH1O94885 1247 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 MX1P20591 662 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 PDE1AP54750 535 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 C8orf34Q49A92 452 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 ITGA6P23229 1130 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 ERFEQ4G0M1 354 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 TTC22Q5TAA0 569 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 GREM2Q9H772 168 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 EYA2O00167 538 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 MSH5O43196 834 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 BAG6P46379 1132 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 AACSQ86V21 672 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 NPHP1O15259 732 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 CIAO1O76071 339 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 GYS1P13807 737 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 TFCP2Q12800 502 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 NFIXQ14938 502 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRR-209ENST00000549308 LRRC24Q50LG9 513 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 STAP2Q9UGK3 403 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 FBXO3Q9UK99 471 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 AOX1Q06278 1338 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 GPATCH3Q96I76 525 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 STK32BQ9NY57 414 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 ABCC12Q96J65 1359 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 TNNI3KQ59H18 835 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 RTL9Q8NET4 1388 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 CASZ1Q86V15 1759 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 ERC2O15083 957 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 METTL24Q5JXM2 366 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 CNBD1Q8NA66 436 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 NLRP3Q96P20 1036 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 GPR108Q9NPR9 543 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 CDC45O75419 566 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 SERPINB2P05120 415 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 SDSP20132 328 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 TM4SF1P30408 202 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 SLC15A2Q16348 729 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 LRP5O75197 1615 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 ST5P78524 1137 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF609O15014 1411 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRR-209ENST00000549308 SPEF2Q9C093 1822 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 RILPL2Q969X0 211 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 DDR1Q08345 913 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC125Q86Z20 511 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms