RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	SIL1	Q9H173	461 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	C4B	P0C0L5	1744 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	RTL9	Q8NET4	1388 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	SSFA2	P28290	1259 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	TNNI3K	Q59H18	835 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	TICAM2	Q86XR7	235 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	SETDB2	Q96T68	719 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARBP2-208	ENST00000547541	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	ITGA6	P23229	1130 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	TFCP2	Q12800	502 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	CNTROB	Q8N137	903 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	ATP5J	P18859	108 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	SYNE4	Q8N205	404 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	GREM2	Q9H772	168 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	SCN7A	Q01118	1682 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	APBA3	O96018	575 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	LRRC24	Q50LG9	513 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	PROM2	Q8N271	834 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	EVI5L	Q96CN4	794 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	HIP1	O00291	1037 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	REC8	O95072	547 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	12.3	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	RILPL2	Q969X0	211 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	CHML	P26374	656 aa		12.29	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	ERFE	Q4G0M1	354 aa		12.29	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	NLRP3	Q96P20	1036 aa		12.29	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		12.29	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM177B	A6PVY3	158 aa		12.28	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		12.28	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	IL27	Q8NEV9	243 aa		12.28	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		12.28	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	AKT1S1	Q96B36	256 aa		12.28	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	MYH3	P11055	1940 aa		12.28	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		12.28	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541	LAMB2	P55268	1798 aa		12.28	□□□□□ -0.44
TARBP2-208	ENST00000547541		A0A1B0GUL7	405 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	PDE8B	O95263	885 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	GYS1	P13807	737 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	TM4SF1	P30408	202 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	METTL24	Q5JXM2	366 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	HAUS7	Q99871	368 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	USP26	Q9BXU7	913 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	ABCC12	Q96J65	1359 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		12.27	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		12.26	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		12.26	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		12.26	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	PHF14	O94880	888 aa		12.26	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	TIMM10	P62072	90 aa		12.26	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	NFIX	Q14938	502 aa		12.26	□□□□□ -0.45
TARBP2-208	ENST00000547541	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		12.26	□□□□□ -0.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms