RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 TMC4Q7Z404 712 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 SYNE4Q8N205 404 aa22.48■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.48■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 KCNA3P22001 575 aa22.46■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.46■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.45■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 BBOX1O75936 387 aa22.45■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 GRAPQ13588 217 aa22.45■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.45■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.45■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 UTYO14607 1347 aa22.45■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.45■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 RTL9Q8NET4 1388 aa22.43■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.43■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.43■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.43■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 CASP7P55210 303 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 PDE3AQ14432 1141 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 CCDC93Q567U6 631 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 USP44Q9H0E7 712 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 SBF1O95248 1867 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.41■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.41■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.41■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.41■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 C21orf2O43822 256 aa22.4■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.4■■□□□ 1.18
BRF1-209ENST00000547052 GNAI2P04899 355 aa22.39■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 ITGA6P23229 1130 aa22.39■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.39■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 SUCLG2Q96I99 432 aa22.39■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 PLIN1O60240 522 aa22.38■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 FAM161AQ3B820 660 aa22.38■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 PANK1Q8TE04 598 aa22.38■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 GREM2Q9H772 168 aa22.38■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 CSF1RP07333 972 aa22.37■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 MEIS3Q99687 375 aa22.37■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.37■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 FOXO4P98177 505 aa22.36■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 SP8Q8IXZ3 490 aa22.36■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.36■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.36■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 TNNQ9UQP3 1299 aa22.36■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 RLBP1P12271 317 aa22.35■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.34■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 COG6Q9Y2V7 657 aa22.34■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.33■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.33■■□□□ 1.17
BRF1-209ENST00000547052 MPNDQ8N594 471 aa22.32■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 A0A1B0GUL6 1792 aa22.32■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.31■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.31■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.31■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.3■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.3■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.3■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 PSMD1Q99460 953 aa22.3■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 EYA3Q99504 573 aa22.3■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 XDHP47989 1333 aa22.3■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 LMNB1P20700 586 aa22.29■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 KCNJ4P48050 445 aa22.29■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.29■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 SRGAP3O43295 1099 aa22.28■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 KAZALD1Q96I82 304 aa22.28■■□□□ 1.16
BRF1-209ENST00000547052 C6orf229H3BNL8 230 aa22.27■■□□□ 1.16
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