RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 G3V3G9 751 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ANXA1P04083 346 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 POTEIP0CG38 1075 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 POTEJP0CG39 1038 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 GCC1Q96CN9 775 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 EYA3Q99504 573 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 MYD88Q99836 296 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 BCORQ6W2J9 1755 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE8AO60658 829 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 GRAPQ13588 217 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT24Q2M2I5 525 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 LDHDQ86WU2 507 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 SP8Q8IXZ3 490 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 NIM1KQ8IY84 436 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 FLIIQ13045 1269 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 TNIP1Q15025 636 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC184Q52MB2 194 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 SYNE4Q8N205 404 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 MPNDQ8N594 471 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM89AQ96GI7 184 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 NUP98P52948 1817 aa7.11□□□□□ -1.27
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CLSTN3-215ENST00000544584 GPC2Q8N158 579 aa7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPYL6Q8N831 410 aa7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 LINS1Q8NG48 757 aa7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.1□□□□□ -1.27
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CLSTN3-215ENST00000544584 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCC12Q96J65 1359 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCC4O15439 1325 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPRCP08575 1304 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 CDHR2Q9BYE9 1310 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 PPIP5K2O43314 1243 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 CA12O43570 354 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 DGKZQ13574 1117 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 HACL1Q9UJ83 578 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 CACNA1FO60840 1977 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 C6orf229H3BNL8 230 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 FZD9O00144 591 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 ALDH1L1O75891 902 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 MMP14P50281 582 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 SOX10P56693 466 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 GCKRQ14397 625 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 WASHC4Q2M389 1173 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 GGA1Q9UJY5 639 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.08□□□□□ -1.28
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