RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa12.42□□□□□ -0.42
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CS-202ENST00000542324 IQCB1Q15051 598 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 BICD2Q8TD16 824 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.42□□□□□ -0.42
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CS-202ENST00000542324 ERO1AQ96HE7 468 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 PGBD1Q96JS3 809 aa12.42□□□□□ -0.42
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CS-202ENST00000542324 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
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CS-202ENST00000542324 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 KCNJ6P48051 423 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 PTPN14Q15678 1187 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 CCDC144BQ3MJ40 725 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 FAM173BQ6P4H8 233 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 KSR2Q6VAB6 950 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-202ENST00000542324 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 NLRP6P59044 892 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP12.39□□□□□ -0.437e-8■■■□□ 15.6
CS-202ENST00000542324 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 CHMP4CQ96CF2 233 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 FSD1Q9BTV5 496 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 ANO10Q9NW15 660 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 RCOR1Q9UKL0 485 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 HEG1Q9ULI3 1381 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 A0A0D9SFI3 127 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 TICAM2Q86XR7 235 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 LINS1Q8NG48 757 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 BRF1Q92994 677 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 NFAT5O94916 1531 aa12.38□□□□□ -0.43
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CS-202ENST00000542324 CCDC66A2RUB6 948 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 SASH1O94885 1247 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 SLFN14P0C7P3 912 aa12.38□□□□□ -0.43
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CS-202ENST00000542324 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 TBX22Q9Y458 520 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 ABCC6O95255 1503 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 LAMA4Q16363 1823 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 H3BQV1 296 aa12.37□□□□□ -0.43
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CS-202ENST00000542324 SLU7O95391 586 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 MLECQ14165 292 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 IFFO2Q5TF58 517 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 NEK1Q96PY6 1258 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa12.37□□□□□ -0.43
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CS-202ENST00000542324 TERF2Q15554 542 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 CCDC150Q8NCX0 1101 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 IP6K1Q92551 441 aa12.36□□□□□ -0.43
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