RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS6KA4O75676 772 aa24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 MCCP23508 829 aa24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 CNTROBQ8N137 903 aa24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 GPATCH3Q96I76 525 aa24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 SUSD4Q5VX71 490 aa24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 SCN7AQ01118 1682 aa24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO41Q8TF61 875 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 GNPATO15228 680 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 CSF1RP07333 972 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 RXRBP28702 533 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 C4AP0C0L4 1744 aa24.58■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 MCM4P33991 863 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 ANAPC15P60006 121 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 AACSQ86V21 672 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM177BA6PVY3 158 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 AK9Q5TCS8 1911 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 POTEAQ6S8J7 498 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 TFCP2Q12800 502 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 PARP10Q53GL7 1025 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 NARFQ9UHQ1 456 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 NTSR2O95665 410 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 CTSWP56202 376 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC24Q50LG9 513 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 PROM2Q8N271 834 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMB2P55268 1798 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE8AO60658 829 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 GREM2Q9H772 168 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 EYA2O00167 538 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 SGSM2O43147 1006 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 IL17RAQ96F46 866 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 CASZ1Q86V15 1759 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-211ENST00000539589 RGL2O15211 777 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 NEK4P51957 841 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TNNI3KQ59H18 835 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 EVI5LQ96CN4 794 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 MCM2P49736 904 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 AK7Q96M32 723 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 IL25Q9H293 177 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CIAO1O76071 339 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PHF14O94880 888 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGA6P23229 1130 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 IL27Q8NEV9 243 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PALD1Q9ULE6 856 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 GBP4Q96PP9 640 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ZPR1O75312 459 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 HSPA4P34932 840 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TXNRD1Q16881 649 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RAD50Q92878 1312 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ERFEQ4G0M1 354 aa24.45■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.45■■□□□ 1.5
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