RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538860.1

ADD1-223, Transcript of adducin 1, human

TSL 3

Gene ADD1, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-223	ENST00000538860	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
ADD1-223	ENST00000538860	RTL9	Q8NET4	1388 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ADD1-223	ENST00000538860	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
ADD1-223	ENST00000538860	BCAR3	O75815	825 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ADD1-223	ENST00000538860	CSF1R	P07333	972 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ADD1-223	ENST00000538860	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
ADD1-223	ENST00000538860	SP8	Q8IXZ3	490 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ADD1-223	ENST00000538860	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ADD1-223	ENST00000538860	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
ADD1-223	ENST00000538860	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ADD1-223	ENST00000538860	CTSW	P56202	376 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	CCDC93	Q567U6	631 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	ABCC4	O15439	1325 aa		18.75	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		18.75	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		18.74	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	PSMD1	Q99460	953 aa		18.74	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	USP44	Q9H0E7	712 aa		18.74	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	VPS33B	Q9H267	617 aa		18.74	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	SLX4	Q8IY92	1834 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	NFKBIE	O00221	500 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	TRIM27	P14373	513 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	LMNB1	P20700	586 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	LAMB2	P55268	1798 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	FOXO4	P98177	505 aa		18.72	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	SNED1	Q8TER0	1413 aa		18.72	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	18.71	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		18.71	■□□□□ 0.59
ADD1-223	ENST00000538860	MS4A1	P11836	297 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	GREM2	Q9H772	168 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	KAZALD1	Q96I82	304 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	MPND	Q8N594	471 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	GNAI3	P08754	354 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ITGA6	P23229	1130 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	PRELP	P51888	382 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	OLFM4	Q6UX06	510 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SUCLG2	Q96I99	432 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	RNF181	Q9P0P0	153 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	RASSF7	Q02833	373 aa		18.65	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		18.65	■□□□□ 0.58
ADD1-223	ENST00000538860	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	FAM161A	Q3B820	660 aa		18.64	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		18.63	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		18.62	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		18.62	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		18.62	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	MYH3	P11055	1940 aa		18.61	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		18.61	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	XDH	P47989	1333 aa		18.61	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	PDE3A	Q14432	1141 aa		18.61	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		18.61	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		18.61	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	GPSM2	P81274	684 aa		18.6	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		18.6	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	MTX1	Q13505	466 aa		18.6	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	JDP2	Q8WYK2	163 aa		18.6	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	MEIS3	Q99687	375 aa		18.6	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	FBXO3	Q9UK99	471 aa		18.6	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	TNN	Q9UQP3	1299 aa		18.6	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	SBF1	O95248	1867 aa		18.6	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	FZD9	O00144	591 aa		18.59	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
ADD1-223	ENST00000538860	ATP2B4	P23634	1241 aa		18.59	■□□□□ 0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms