RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538734.6

MIR9-3HG-202, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 2

Gene MIR9-3HG, Length 1,877 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SETDB2Q96T68 719 aa25.1■■□□□ 1.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.09■■□□□ 1.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.09■■□□□ 1.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GREM2Q9H772 168 aa25.09■■□□□ 1.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EYA2O00167 538 aa25.08■■□□□ 1.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AOX1Q06278 1338 aa25.07■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CIAO1O76071 339 aa25.07■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TFCP2Q12800 502 aa25.07■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AACSQ86V21 672 aa25.07■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ITGA6P23229 1130 aa25.06■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FBXO3Q9UK99 471 aa25.06■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SEC24BO95487 1268 aa25.06■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ERFEQ4G0M1 354 aa25.06■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LRRC24Q50LG9 513 aa25.06■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.05■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SDSP20132 328 aa25.05■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NYXQ9GZU5 481 aa25.05■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AKT1S1Q96B36 256 aa25.04■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LAMB2P55268 1798 aa25.04■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.04■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.04■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.04■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.04■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.03■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF827Q17R98 1081 aa25.03■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.03■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GYS1P13807 737 aa25.02■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TNNI3KQ59H18 835 aa25.02■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.02■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.02■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.02■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NFIXQ14938 502 aa25.02■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.02■■□□□ 1.6
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.01■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GPATCH3Q96I76 525 aa25■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GPR108Q9NPR9 543 aa25■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CDC45O75419 566 aa25■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CAMKK2Q96RR4 588 aa25■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RTL9Q8NET4 1388 aa24.99■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.99■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ERC2O15083 957 aa24.98■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.98■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.98■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.98■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.97■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCC12Q96J65 1359 aa24.97■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TM4SF1P30408 202 aa24.96■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.96■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.96■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.96■■□□□ 1.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TIMM10P62072 90 aa24.94■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RILPL2Q969X0 211 aa24.94■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NLRP3Q96P20 1036 aa24.94■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.94■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.94■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 METTL24Q5JXM2 366 aa24.93■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.93■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.93■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CASZ1Q86V15 1759 aa24.93■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LRP5O75197 1615 aa24.92■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 A0A1B0GUL7 405 aa24.92■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NPHP1O15259 732 aa24.92■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CNBD1Q8NA66 436 aa24.92■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.92■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF609O15014 1411 aa24.91■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.91■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MSH5O43196 834 aa24.91■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATP5JP18859 108 aa24.91■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CASC1Q6TDU7 716 aa24.91■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.9■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SERPINB2P05120 415 aa24.9■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CNTROBQ8N137 903 aa24.9■■□□□ 1.58
MIR9-3HG-202ENST00000538734 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms