RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 NLRP3Q96P20 1036 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 RTL9Q8NET4 1388 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.87□□□□□ -0.03
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LMO3-218ENST00000538020 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 FAM161AQ3B820 660 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 SMC5Q8IY18 1101 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 MTFR1LQ9H019 292 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 DCTPP1Q9H773 170 aa14.86□□□□□ -0.03
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LMO3-218ENST00000538020 ITGA6P23229 1130 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 COPRSQ9NQ92 184 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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LMO3-218ENST00000538020 POLD1P28340 1107 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 GREM2Q9H772 168 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-218ENST00000538020 FBXO3Q9UK99 471 aa14.84□□□□□ -0.03
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LMO3-218ENST00000538020 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 LRP5O75197 1615 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 ZBTB7AO95365 584 aa14.82□□□□□ -0.04
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LMO3-218ENST00000538020 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 CIAO1O76071 339 aa14.81□□□□□ -0.04
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LMO3-218ENST00000538020 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.81□□□□□ -0.04
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LMO3-218ENST00000538020 SIL1Q9H173 461 aa14.81□□□□□ -0.04
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LMO3-218ENST00000538020 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO3-218ENST00000538020 NUCB1Q02818 461 aa14.8□□□□□ -0.04
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LMO3-218ENST00000538020 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.79□□□□□ -0.04
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LMO3-218ENST00000538020 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.79□□□□□ -0.04
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LMO3-218ENST00000538020 SPEF2Q9C093 1822 aa14.78□□□□□ -0.04
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LMO3-218ENST00000538020 GRAPQ13588 217 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.77□□□□□ -0.05
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LMO3-218ENST00000538020 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 H0YIN7 160 aa14.76□□□□□ -0.05
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LMO3-218ENST00000538020 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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LMO3-218ENST00000538020 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 MASTLQ96GX5 879 aa14.76□□□□□ -0.05
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LMO3-218ENST00000538020 METTL24Q5JXM2 366 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 STYK1Q6J9G0 422 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 SOCS7O14512 581 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-218ENST00000538020 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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