RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534404.1

LRP4-205, Transcript of LDL receptor related protein 4, human

TSL 5

Gene LRP4, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP4-205	ENST00000534404	HSPA6	P17066	643 aa		42.25	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF521	Q96K83	1311 aa		42.24	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	TMC4	Q7Z404	712 aa		42.23	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		42.23	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	IGKV5-2	P06315	115 aa		42.22	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	WDR90	Q96KV7	1748 aa		42.22	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	MPND	Q8N594	471 aa		42.21	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		42.21	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	PDE8A	O60658	829 aa		42.2	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
LRP4-205	ENST00000534404	POTEC	B2RU33	542 aa		42.19	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		42.19	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	TAF1	P21675	1872 aa		42.18	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	FZD9	O00144	591 aa		42.18	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	PPIP5K2	O43314	1243 aa		42.18	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		42.17	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	FSTL1	Q12841	308 aa		42.17	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		42.17	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		42.17	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		42.16	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	NIM1K	Q8IY84	436 aa		42.15	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		42.15	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	CACNA1F	O60840	1977 aa		42.14	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404		E9PSI1	815 aa		42.14	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	AOC3	Q16853	763 aa		42.14	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	VPS33B	Q9H267	617 aa		42.14	■■■■■ 4.34
LRP4-205	ENST00000534404	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		42.13	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		42.11	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	42.1	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		42.1	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	GPC2	Q8N158	579 aa		42.09	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	GCKR	Q14397	625 aa		42.08	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		42.08	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	LINS1	Q8NG48	757 aa		42.08	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	COL4A5	P29400	1685 aa		42.08	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404	APLP1	P51693	650 aa		42.07	■■■■■ 4.33
LRP4-205	ENST00000534404		F6X3S4	739 aa		42.06	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	CTSW	P56202	376 aa		42.06	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404		H7C1W4	665 aa		42.05	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	SLFN5	Q08AF3	891 aa		42.05	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	HACL1	Q9UJ83	578 aa		42.04	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		42.03	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		42.03	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	C6orf229	H3BNL8	230 aa		42.02	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	GPSM2	P81274	684 aa		42.02	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		42.02	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	42.02	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		42.02	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	COL4A1	P02462	1669 aa		42.02	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		42.01	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	SCN4A	P35499	1836 aa		42.01	■■■■■ 4.32
LRP4-205	ENST00000534404	WASHC4	Q2M389	1173 aa		42	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		42	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	41.98	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	41.98	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		41.98	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	EPHX2	P34913	555 aa		41.97	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	BEND3	Q5T5X7	828 aa		41.97	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		41.97	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	EYA3	Q99504	573 aa		41.97	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	POTEI	P0CG38	1075 aa		41.96	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	POTEJ	P0CG39	1038 aa		41.96	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	CHADL	Q6NUI6	762 aa		41.96	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	MIER1	Q8N108	512 aa		41.96	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	GREM2	Q9H772	168 aa		41.96	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	POLL	Q9UGP5	575 aa		41.96	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		41.96	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	RIMBP2	O15034	1052 aa		41.95	■■■■■ 4.31
LRP4-205	ENST00000534404	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		41.94	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	MYH3	P11055	1940 aa		41.93	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	CXCL9	Q07325	125 aa		41.93	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	LDHD	Q86WU2	507 aa		41.93	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		41.93	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		41.93	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	CASP7	P55210	303 aa		41.92	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	41.92	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		41.91	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		41.91	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	GGA1	Q9UJY5	639 aa		41.91	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	UFL1	O94874	794 aa		41.9	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	RTL9	Q8NET4	1388 aa		41.89	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	RAD17	O75943	681 aa		41.89	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	TNIP1	Q15025	636 aa		41.89	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	41.89	■■■■■ 4.3
LRP4-205	ENST00000534404	SCNN1D	P51172	638 aa		41.88	■■■■■ 4.29
LRP4-205	ENST00000534404	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	41.88	■■■■■ 4.29
LRP4-205	ENST00000534404	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		41.88	■■■■■ 4.29
LRP4-205	ENST00000534404	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		41.88	■■■■■ 4.29
LRP4-205	ENST00000534404	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	41.88	■■■■■ 4.29

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